RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A YMR181CQ03231 154 aa2.06□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A PDS5Q04264 1277 aa2.06□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A VMS1Q04311 632 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A KAR9P32526 644 aa2.05□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A MUD1P32605 298 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A FRE4P53746 719 aa2.05□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A YDR239CQ03780 787 aa2.05□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A YDR387CQ04162 555 aa2.05□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A MRD1Q06106 887 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A CBS1P14066 229 aa2.04□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A PWP2P25635 923 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A MCM10P32354 571 aa2.04□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A MIG3P39943 394 aa2.04□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A YGR066CP53242 292 aa2.04□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A IGO1P53897 168 aa2.04□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A NCS2P53923 493 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A IES4Q08561 116 aa2.04□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A CTI6Q08923 506 aa2.04□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A YRM1Q12340 786 aa2.04□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A SNT1P25357 1226 aa2.03□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A ECM25P32525 599 aa2.03□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A MRE11P32829 692 aa2.03□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A YKL097CP34245 136 aa2.03□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A SEO1P39709 593 aa2.03□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A YIF1P53845 314 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A TAP42Q04372 366 aa2.03□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A RCN2Q12044 265 aa2.03□□□□□ -2.08
YMR001C-AYMR001C-A TEF1P02994 458 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A TOP1P04786 769 aa2.02□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A IDH2P28241 369 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A AFG1P32317 509 aa2.02□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A CCT2P39076 527 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A YNR048WP53740 393 aa2.02□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A DSL1P53847 754 aa2.02□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A VHS1Q03785 461 aa2.02□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A OPY2Q06810 360 aa2.02□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A YPQ1Q12010 308 aa2.02□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A IZH2Q12442 317 aa2.02□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A FOB1O13329 566 aa2.01□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A APE2P32454 952 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A BMT2P38278 337 aa2.01□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A PLP2Q12017 286 aa2.01□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A BI3Q9ZZW7 517 aa2.01□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data2□□□□□ -2.09not detected
YMR001C-AYMR001C-A TRX2P22803 104 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A RPI1P23250 407 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A SPB1P25582 841 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A PRP21P32524 280 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A CST26P38226 397 aa2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2□□□□□ -2.09not detected
YMR001C-AYMR001C-A YER186CP40101 306 aa2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A DFG10P40526 253 aa2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A ECM27P47144 725 aa2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A YGR149WP48236 432 aa2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A ADA2Q02336 434 aa2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A HSP31Q04432 237 aa2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A SEC39Q12745 709 aa2□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A YLR278CQ05854 1341 aa1.99□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A RHO2P06781 192 aa1.99□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A AAC3P18238 307 aa1.99□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A RML2P32611 393 aa1.99□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A CHK1P38147 527 aa1.99□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A TFG2P41896 400 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A ORT1Q12375 292 aa1.99□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A ENT1Q12518 454 aa1.99□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A PSK1P31374 1356 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A ARG4P04076 463 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A PRB1P09232 635 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A NAM2P11325 894 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A RAD14P28519 371 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A HIR2P32480 875 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A NIP100P33420 868 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A SPT10P35208 640 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A TIM17P39515 158 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A YEL057CP39983 233 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A MET28P40573 187 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A CHS6P40955 746 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A RMD9P53140 646 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A ECM11Q04110 302 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A LIP2Q06005 328 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A YPR091CQ06833 770 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A YPS3Q12303 508 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A RTP1Q12751 981 aa1.98□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A SEM1O94742 89 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A OLE1P21147 510 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A IES6P32617 166 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A GYP6P32806 458 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A REC114P32841 428 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A RTC2P38279 296 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A VMA13P41807 478 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A MDE1P47095 244 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A UPF3P48412 387 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A AZR1P50080 613 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A VPS75P53853 264 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A MRPS16Q02608 121 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A RFM1Q12192 310 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A PRM7Q12459 698 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A YML133CQ03099 1374 aa1.97□□□□□ -2.09
YMR001C-AYMR001C-A YLL067CQ07888 1374 aa1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.6 ms