RNA–Protein interactions for RNA: YML121W

GTR1, Transcript of Cytoplasmic GTPase, yeast

Gene GTR1, Length 933 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTR1	YML121W	YJL043W	P47053	257 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	DUG3	P53871	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	STP1	Q00947	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	SMA2	Q04658	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	IPK1	Q06667	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	SCEI	P03882	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	GPA1	P08539	472 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	SNF3	P10870	884 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	PET18	P25362	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	YBR139W	P38109	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	RRN10	P38204	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	EFM2	P38347	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	UBA4	P38820	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
GTR1	YML121W	ERV46	P39727	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	MSS51	P32335	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	ECM25	P32525	599 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	MSN2	P33748	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	DUG2	P38149	878 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	HSM3	P38348	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	STN1	P38960	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	ASI1	P54074	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	SMA1	Q02651	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTR1	YML121W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	MAK32	P23060	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	ATP11	P32453	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	RPC34	P32910	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	ROT2	P38138	954 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SPC97	P38863	823 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	AIM20	P40451	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	STE23	Q06010	1027 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PDR8	Q06149	701 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SOR2	Q07786	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	APC5	Q08683	685 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	GAL3	P13045	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
GTR1	YML121W	YBL028C	P38202	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	GAT2	P40209	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YIL060W	P40519	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SYG1	P40528	902 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SAS2	P40963	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	POP1	P41812	875 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	BUD32	P53323	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	MPS1	P54199	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	SHR3	Q02774	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	NSE1	Q07913	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
GTR1	YML121W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YPR089W	O13585	888 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	BI2	P03873	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PEP5	P12868	1029 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	TYR1	P20049	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PSO2	P30620	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	YSC83	P32792	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	REC114	P32841	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	COY1	P34237	679 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	OCT1	P35999	772 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	QDR3	P38227	689 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	LAM5	P43560	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	PHO86	P46956	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	BRO1	P48582	844 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	ORC5	P50874	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	HSP31	Q04432	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	MCP2	Q06567	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	MCH4	Q08268	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	GEP3	Q08622	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	BUG1	Q12191	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTR1	YML121W	MRPL37	P36532	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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