RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	CTS2	Q06350	511 aa		5.67	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	MCH5	Q08777	521 aa		5.67	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	SCEI	P03882	235 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	YCL068C	P25593	260 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	CYM1	P32898	989 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	TRM2	P33753	639 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	ALY1	P36117	915 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	MNN2	P38069	597 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	MAL32	P38158	584 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.66	□□□□□ -1.5	RIP-Chip
GPT2	YKR067W	FES1	P38260	290 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	AME1	P38313	324 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	YHR202W	P38887	602 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	RGI2	P40188	164 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	ELP2	P42935	788 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	GTO1	P48239	356 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	MAL12	P53341	584 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	AQR1	P53943	586 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	HXT15	P54854	567 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	YOL019W	Q08157	551 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	TAF10	Q12030	206 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	YDR262W	Q12331	272 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	SET6	Q12529	373 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	PDE2	P06776	526 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	AFG1	P32317	509 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	RTG1	P32607	177 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	ASH1	P34233	588 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	APN2	P38207	520 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	AVT2	P39981	480 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	YIL001W	P40560	513 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	IRC7	P43623	340 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	YGL185C	P53100	379 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	YNL143C	P53908	130 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	ASI1	P54074	624 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	MRP51	Q02950	344 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	ATG33	Q06485	197 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	ATP12	P22135	325 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	YCR101C	P25607	182 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	CIN8	P27895	1000 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	THI2	P38141	450 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	SPC97	P38863	823 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	CAF16	P43569	289 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	MND1	P53102	219 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	BNA7	Q04066	261 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	PRM6	Q04705	352 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	ROY1	Q04847	553 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	SGO1	Q08490	590 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	SOG2	Q08817	791 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	RDR1	Q08904	546 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	TRE1	Q08919	783 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	NMD4	Q12129	218 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GPT2	YKR067W	RIF1	P29539	1916 aa		5.65	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	POX1	P13711	748 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	SOK1	P40317	901 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	ARG2	P40360	574 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	YIL054W	P40524	105 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	UFE1	P41834	346 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	TAH11	P47112	604 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	YJR154W	P47181	346 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	DIA3	P52290	468 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	YSA1	Q01976	231 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	NUP116	Q02630	1113 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	CTF19	Q02732	369 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	MMT1	Q03218	510 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	YDR248C	Q03786	193 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	HDA2	Q06629	674 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	CTF3	Q12748	733 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	SWI5	P08153	709 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	CDC23	P16522	626 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	SLY1	P22213	666 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	YSC84	P32793	468 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	YER121W	P40076	114 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	SLM1	P40485	686 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	FMC1	P40491	155 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	MAF1	P41910	395 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	RGD2	P43556	714 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	BIO4	P53630	237 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	SLG1	P54867	378 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	PEX12	Q04370	399 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GPT2	YKR067W	SPO77	Q06134	477 aa		5.64	□□□□□ -1.51

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.8 ms