RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	SPT20	P50875	604 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	SCS3	P53012	380 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	INN1	P53901	409 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	SLT2	Q00772	484 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	SKO1	Q02100	647 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	INA17	Q02888	182 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	URH1	Q04179	340 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	APC4	Q04601	652 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	ADY4	Q05955	493 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	PDR8	Q06149	701 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	YPS7	Q06325	596 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	STP4	Q07351	490 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	THI21	Q08975	551 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	BTS1	Q12051	335 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	ERP3	Q12403	225 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	SRN2	Q99176	213 aa		4.28	□□□□□ -1.72
KTR2	YKR061W	GAL80	P04387	435 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	PEP5	P12868	1029 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	CMK2	P22517	447 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	ARG1	P22768	420 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	YUR1	P26725	428 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	RML2	P32611	393 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	BCS1	P32839	456 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	TRM2	P33753	639 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	SFB3	P38810	929 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	PCI8	P40512	444 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	YGR012W	P53206	393 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	RTT102	P53330	157 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	TRS31	Q03337	283 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	SLD5	Q03406	294 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	RRG8	Q06109	277 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	SEC10	Q06245	871 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	ATG17	Q06410	417 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	NRT1	Q08485	598 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	SUT2	Q12286	268 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	SUL2	Q12325	893 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	SPE4	Q12455	300 aa		4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	RAD7	P06779	565 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	MSF1	P08425	469 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	RAP1	P11938	827 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	HMG2	P12684	1045 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	ADH7	P25377	361 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	YCR061W	P25639	631 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	ATP7	P30902	174 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	SPR1	P32603	445 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	MRPL10	P36520	322 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	APT2	P36973	181 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	THI2	P38141	450 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	OPY1	P38271	328 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	SWC5	P38326	303 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	GIC1	P38785	314 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	RTT107	P38850	1070 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	FKH2	P41813	862 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	KAP114	P53067	1004 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	VPS62	P53285	467 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	TNA1	P53322	534 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	DIP5	P53388	608 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	RNT1	Q02555	471 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	ACL4	Q03771	387 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	FIN1	Q03898	291 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	TLG2	Q08144	397 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	FRE3	Q08905	711 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	TGS1	Q12052	315 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	SEY1	Q99287	776 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	MYO1	P08964	1928 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.25	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	CDC6	P09119	513 aa		4.25	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
KTR2	YKR061W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.2 ms