RNA–Protein interactions for RNA: YGR281W

YOR1, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene YOR1, Length 4,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR1	YGR281W	YBR241C	P38142	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	COQ5	P49017	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YGL101W	P53144	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	NUP49	Q02199	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MFG1	Q07684	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SUC2	P00724	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SPE1	P08432	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	APN1	P22936	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	IFM1	P25038	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SEC17	P32602	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MRP4	P32902	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PDR3	P33200	976 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RTC2	P38279	296 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	HXT5	P38695	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ARP1	P38696	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	CTF8	P38877	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	EFM3	P47163	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
YOR1	YGR281W	BIO2	P32451	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YBR056W	P38081	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YJL055W	P47044	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	NAS6	P50086	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	APC9	Q12107	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ICT1	Q12385	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	APC2	Q12440	853 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SPS4	P09937	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	AHC2	P25649	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PHO91	P27514	894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	FET3	P38993	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	DUN1	P39009	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ECM10	P39987	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	FET5	P43561	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	VAC7	P53950	1165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	CYK3	Q07533	885 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	NSE1	Q07913	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MRX4	Q12467	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PRI2	P20457	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	AFG1	P32317	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	DCG1	P32460	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	POP1	P41812	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	BUD17	P53727	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SNX41	Q04053	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YAK1	P14680	807 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RAM1	P22007	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	OMA1	P36163	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	IST2	P38250	946 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	LAG1	P38703	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	NEM1	P38757	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	FAD1	P38913	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	IDP2	P41939	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RTS3	P53289	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SPO77	Q06134	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MED2	Q12124	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SEC12	P11655	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SNF6	P18888	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YOR1	YGR281W	SDH3	P33421	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SPT23	P35210	1082 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	LRG1	P35688	1017 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ELO3	P40319	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	IRC6	P43615	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	HER2	Q03557	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RAP1	P11938	827 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	HMG1	P12683	1054 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	GMH1	P36125	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RRN10	P38204	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	HPM1	P40481	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	NEO1	P40527	1151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	GAB1	P41733	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SFH5	P47008	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	CGR1	P53188	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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