RNA–Protein interactions for RNA: YGR163W

GTR2, Transcript of Putative GTP binding protein, yeast

Gene GTR2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTR2	YGR163W	YDR131C	Q03899	556 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	HSP31	Q04432	237 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	PBA1	Q05778	276 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YLR108C	Q12259	485 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	SFI1	Q12369	946 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	RRD2	Q12461	358 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	ISN1	Q99312	450 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	RPC53	P25441	422 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	ECM25	P32525	599 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	HCS1	P34243	683 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	VHC1	P38329	1120 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	NDT80	P38830	627 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YIL067C	P40514	678 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	ECM27	P47144	725 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	FMS1	P50264	508 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YIP1	P53039	248 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YOR387C	Q08910	206 aa		3.19	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	CHS1	P08004	1131 aa		3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	PPH22	P23595	377 aa		3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	SDH3	P33421	198 aa		3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	ARA1	P38115	344 aa		3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	MIX23	P38162	196 aa		3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YHR054C	P38780	354 aa		3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YGR210C	P42942	411 aa		3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	SHE10	P53075	577 aa		3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	ERV2	Q12284	196 aa		3.18	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	RIP1	P08067	215 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	CPR4	P25334	318 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YIM1	P28625	365 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	STB6	P36085	766 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	BYE1	P36106	594 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	MST28	P39552	234 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	LAM5	P43560	674 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	GOR1	P53839	350 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	MDG1	P53885	366 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	SGT1	Q08446	395 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	HSP42	Q12329	375 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	RAD61	Q99359	647 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	SNT1	P25357	1226 aa		3.16	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	NAM9	P27929	486 aa		3.16	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.16	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	TIM18	Q08749	192 aa		3.16	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.15	□□□□□ -1.9
GTR2	YGR163W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	REC107	P21651	314 aa		3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	RIB5	P38145	238 aa		3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	REE1	P40893	198 aa		3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	TOF1	P53840	1238 aa		3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	YMR181C	Q03231	154 aa		3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SPC19	Q03954	165 aa		3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SIL1	Q08199	421 aa		3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	REX4	Q08237	289 aa		3.15	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	PDX1	P16451	410 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	LDB16	P25587	256 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	RML2	P32611	393 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
GTR2	YGR163W	YNR048W	P53740	393 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	HER2	Q03557	464 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	ERP4	Q12450	207 aa		3.14	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	ADK2	P26364	225 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	KRE2	P27809	442 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SIN4	P32259	974 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	YEL045C	P32616	141 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	MTC6	P38849	526 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	PRM5	P40476	318 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SAS2	P40963	338 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	NCA3	P46955	337 aa		3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
GTR2	YGR163W	SDT1	P53078	280 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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