RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	BNS1	P50084	137 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	GPI1	P53306	609 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	DIA1	P54005	336 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	HIM1	Q06674	414 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YDL057W	Q07379	328 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	FKS3	Q04952	1785 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	TRP1	P00912	224 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	MAS2	P11914	482 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	XRS2	P33301	854 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.42	□□□□□ -2.34	not detected
CSE1	YGL238W	YKL133C	P36066	463 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YHR131C	P38835	850 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	AXL2	P38928	823 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	IES5	P40060	125 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	PCP1	P53259	346 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	MRPL13	Q02204	264 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	MRP51	Q02950	344 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	ECM30	Q06673	1274 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	MRP13	P12686	339 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	SEC63	P14906	663 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	RAD57	P25301	460 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YME2	P32843	850 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	CSE2	P33308	149 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YBR144C	P34215	104 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YER186C	P40101	306 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	RPN14	P53196	417 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	COS1	P53822	381 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YMR181C	Q03231	154 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	PRM7	Q12459	698 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	RAX2	Q12465	1220 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	RMD5	Q12508	421 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	TPK1	P06244	397 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	DAL2	P25335	343 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	SPS22	P25380	463 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	IMG1	P25626	169 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	MSP1	P28737	362 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	CPR7	P47103	393 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	DIA3	P52290	468 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	GOR1	P53839	350 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YPR091C	Q06833	770 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	FMP27	Q06179	2628 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	BOS1	P25385	244 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	SHP1	P34223	423 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	BNA4	P38169	460 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	RFC3	P38629	340 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	CIN4	P39110	191 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	MIG3	P39943	394 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	BUR6	P40096	142 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	FAR3	P46671	204 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YGR126W	P53274	230 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	HRT1	Q08273	121 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.4	□□□□□ -2.35	not detected
CSE1	YGL238W	SPE2	P21182	396 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	PRD1	P25375	712 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	CDC15	P27636	974 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	MBB1	P39534	108 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	JLP2	P40206	208 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	PSF2	P40359	213 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	VID30	P53076	958 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TOF2	Q02208	771 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	YDR239C	Q03780	787 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	PDS5	Q04264	1277 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SNO4	Q04902	237 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	VPS38	Q05919	439 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	PSR1	Q07800	427 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	THP1	Q08231	455 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	HSP32	Q08992	237 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	EXO70	P19658	623 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	MNS1	P32906	549 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
CSE1	YGL238W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35

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