RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSD1	YGL196W	TAF12	Q03761	539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	HNM1	P19807	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	BUB3	P26449	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	ECM15	P35195	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	PFF1	P38244	976 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	PCA1	P38360	1216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	NAS2	P40555	220 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	ESBP6	P53918	673 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	RIM13	Q03792	727 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	NSE1	Q07913	336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	PSY3	Q12318	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	SRN2	Q99176	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	COX3	P00420	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	ALG1	P16661	449 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	ACH1	P32316	526 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	NDI1	P32340	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	ECM25	P32525	599 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	FLO5	P38894	1075 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	STN1	P38960	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	GAT2	P40209	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YPS6	P40583	537 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	GAT1	P43574	510 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	GUF1	P46943	645 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	PHO86	P46956	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	SOR2	Q07786	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	REX3	Q12090	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	MDM10	P18409	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	MGR1	P25573	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	RRF1	P38771	230 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	TRS85	P46944	698 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	VPS74	Q06385	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	SYO1	Q07395	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YEH2	Q07950	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	BSC1	Q12140	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	UBX3	Q12229	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	SEC62	P21825	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	PPZ1	P26570	692 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	SPC97	P38863	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	PES4	P39684	611 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YAL037W	P39728	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	MDV1	P47025	714 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	BET4	Q00618	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	ADA2	Q02336	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	PNG1	Q02890	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	URH1	Q04179	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	THI7	Q05998	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	RKM5	Q12367	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	RDS1	P25611	832 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	BRO1	P48582	844 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	GPI8	P49018	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	PIB2	P53191	635 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	IRC15	Q02733	499 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSD1	YGL196W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	CTR86	P25355	563 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	FRE1	P32791	686 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	XBP1	P40489	647 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	YIL089W	P40500	205 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	YIR014W	P40570	242 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	MDE1	P47095	244 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	EFM3	P47163	339 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	SHE4	P51534	789 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	AQR1	P53943	586 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	IPK1	Q06667	281 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	REX4	Q08237	289 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	SGT1	Q08446	395 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	NRT1	Q08485	598 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DSD1	YGL196W	ATG34	Q12292	412 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.7 ms