RNA–Protein interactions for RNA: YGL006W

PMC1, Transcript of Vacuolar Ca2+ ATPase involved in depleting cytosol of Ca2+ ions, yeast

Gene PMC1, Length 3,522 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMC1	YGL006W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	ZRT3	P34240	503 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	YMC2	P38087	329 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	CDC1	P40986	491 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	RET2	P43621	546 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	MDV1	P47025	714 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	EAF6	P47128	113 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	FMP48	P53233	369 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	ASI3	P53983	676 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	MNE1	P24720	663 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	OCA4	P25366	362 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	STE14	P32584	239 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	SEC17	P32602	292 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	RSM22	P36056	628 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	COS111	P38308	924 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	RGA1	P39083	1007 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	YIR007W	P40566	764 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	FYV6	P53913	173 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	VAC7	P53950	1165 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	MPS1	P54199	764 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	UNG1	P12887	359 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	NDC1	P32500	655 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	GPB2	P39717	880 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	HAT2	P39984	401 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	RSM7	P47150	247 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	LYS5	P50113	272 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	DIA3	P52290	468 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	YGR168C	P53293	376 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	RRN9	P53437	365 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	CDC14	Q00684	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	RDI1	Q12434	202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMC1	YGL006W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	PEX1	P24004	1043 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	DCC1	P25559	380 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	PRM9	P39551	298 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	MBP1	P39678	833 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	NUP85	P46673	744 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	YGR026W	P53217	278 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	EFM6	P53970	246 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	GAS3	Q03655	524 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	BNA7	Q04066	261 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	YEH1	Q07804	573 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	PMT2	P31382	759 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	PDR3	P33200	976 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	LST4	P34239	828 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	SDS22	P36047	338 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	APD1	P38281	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	UBX7	P38349	436 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	MUP3	P38734	546 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	FET3	P38993	636 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	BIR1	P47134	954 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	PEX31	P53203	462 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	GPN3	Q06543	272 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	GPB1	Q08886	897 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	JLP1	Q12358	412 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	APC2	Q12440	853 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	SKM1	Q12469	655 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	LDB19	Q12502	818 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	RIB3	Q99258	208 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	HXT2	P23585	541 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	CAF4	P36130	643 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	BIG1	P38813	335 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	YHR202W	P38887	602 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	MNN1	P39106	762 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	ACO2	P39533	789 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	EMP65	P40085	556 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	ESL1	P40456	1118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	PKP1	P40530	394 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMC1	YGL006W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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