RNA–Protein interactions for RNA: YFR008W

FAR7, Transcript of Protein involved in recovery from pheromone-induced cell cycle arrest, yeast

Gene FAR7, Length 666 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAR7	YFR008W	JNM1	P36224	373 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	RIB5	P38145	238 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SSN8	P47821	323 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	FMS1	P50264	508 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SIL1	Q08199	421 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SFI1	Q12369	946 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		2.74	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	REV1	P12689	985 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	NAM9	P27929	486 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	ERG3	P32353	365 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	ECM25	P32525	599 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SWH1	P35845	1188 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	MIX23	P38162	196 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	LAM5	P43560	674 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	MRP51	Q02950	344 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SMA2	Q04658	369 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	TIM18	Q08749	192 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YLR278C	Q05854	1341 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	RIP1	P08067	215 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SPS22	P25380	463 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	RML2	P32611	393 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	STB6	P36085	766 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	MST28	P39552	234 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SAS2	P40963	338 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	SRB7	P47822	140 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	BTN2	P53286	410 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	FRE4	P53746	719 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	TOF1	P53840	1238 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	YMR155W	Q03795	547 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	REX4	Q08237	289 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	ERV2	Q12284	196 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	HSP42	Q12329	375 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAR7	YFR008W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	REC107	P21651	314 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	ARA1	P38115	344 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	YHR054C	P38780	354 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.71	□□□□□ -1.98	not detected
FAR7	YFR008W	NCA3	P46955	337 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	MDG1	P53885	366 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	RAD61	Q99359	647 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	SLY1	P22213	666 aa		2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	ITR1	P30605	584 aa		2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	NPL6	P32832	435 aa		2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	YGR210C	P42942	411 aa		2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	HMS2	P47175	358 aa		2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	COS5	P47187	383 aa		2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	SHE10	P53075	577 aa		2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	YGL138C	P53122	345 aa		2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	COS7	Q07788	383 aa		2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	SCM3	Q12334	223 aa		2.7	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	SEC63	P14906	663 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	LDB16	P25587	256 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	SIN4	P32259	974 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	YEL045C	P32616	141 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	YME2	P32843	850 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	MTC6	P38849	526 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	FAA2	P39518	744 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	PRM5	P40476	318 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	YNR048W	P53740	393 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	HXT11	P54862	567 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	ADD37	Q03233	198 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	PPM1	Q04081	328 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	TMS1	Q12116	473 aa		2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	SPO7	P18410	259 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	RHB1	P25378	209 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	YCR051W	P25631	222 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	MNS1	P32906	549 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	BYE1	P36106	594 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	MRPL4	P36517	319 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FAR7	YFR008W	PIM1	P36775	1133 aa		2.68	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.8 ms