RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 CTGFP29279 349 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT2P35908 639 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 STAT3P40763 770 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ADCY7P51828 1080 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 C1QTNF8P60827 252 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CRHR2Q13324 411 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 WASF1Q92558 559 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFRSF25Q93038 417 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 M0R2N6 131 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 MEIS2O14770 477 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ADH1CP00326 375 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PGK2P07205 417 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 JUNDP17535 347 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVK-9P63128 1117 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVK-24P63145 666 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTN2Q02246 1040 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.36e-11■□□□□ 10.8
CAPNS1-208ENST00000589162 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 INF2Q27J81 1249 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 IL31RAQ8NI17 732 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 GJA10Q969M2 543 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ANO3Q9BYT9 981 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 C6orf50Q9HD87 102 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF3AQ9Y496 699 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 CLIC4Q9Y696 253 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCB11O95342 1321 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-208ENST00000589162 PLXNB2O15031 1838 aa6.9□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ESYT2A0FGR8 921 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FIBPO43427 364 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPA1O75762 1119 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TDP2O95551 362 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR2MP0CAP2 368 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 BCRP11274 1271 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPA6P17066 643 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PDCP20941 246 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TM4SF4P48230 202 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 NUCB2P80303 420 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SREBF2Q12772 1141 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 NOGQ13253 232 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF174Q15697 407 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CUL5Q93034 780 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 USP28Q96RU2 1077 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF186Q9NXI6 227 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ASTN1O14525 1302 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MYPNQ86TC9 1320 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TCHHQ07283 1943 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SORBS3O60504 671 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 COBLO75128 1261 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 UPP2O95045 317 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 XBP1P17861 261 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PTGS1P23219 599 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MCM7P33993 719 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 C17orf99Q6UX52 265 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.88□□□□□ -1.31
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