RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-222ENST00000567147 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.23■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.23■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 KPNA6O60684 536 aa20.22■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 SMARCA1P28370 1054 aa20.22■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 GNAQP50148 359 aa20.22■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 RASEFQ8IZ41 740 aa20.22■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.22■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.22■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.22■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 CALM1P0DP23 149 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 CALM2P0DP24 149 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 CALM3P0DP25 149 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 RXRAP19793 462 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 SPRED2Q7Z698 418 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.832e-9■□□□□ 8.4
RNPS1-222ENST00000567147 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-222ENST00000567147 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 GH1P01241 217 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 FANCBQ8NB91 859 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 AFG1LQ8WV93 481 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 TLL1O43897 1013 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 NEFLP07196 543 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 TAP1Q03518 808 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 ARHGAP1Q07960 439 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 PGM5Q15124 567 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 IL31RAQ8NI17 732 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 RGS20O76081 388 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 PTPRSQ13332 1948 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 PFKMP08237 780 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 ACTN1P12814 892 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 LAMC2Q13753 1193 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 KRT32Q14532 448 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 COG5Q9UP83 839 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 TET1Q8NFU7 2136 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 MMP3P08254 477 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 CCND2P30279 289 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 CHMP4BP1P59074 171 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 GRB10Q13322 594 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 MICU3Q86XE3 530 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 HLA-CQ95604 372 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 SLC9A7Q96T83 725 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 IQCF3P0C7M6 154 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 CUL5Q93034 780 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RNPS1-222ENST00000567147 LCHNA4D1U4 455 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-222ENST00000567147 MEIS2O14770 477 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-222ENST00000567147 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-222ENST00000567147 TGFB3P10600 412 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-222ENST00000567147 SP2Q02086 613 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-222ENST00000567147 DGKDQ16760 1214 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-222ENST00000567147 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-222ENST00000567147 APOA5Q6Q788 366 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-222ENST00000567147 RETREG2Q8NC44 543 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-222ENST00000567147 KAT2BQ92831 832 aa20.14■□□□□ 0.81
RNPS1-222ENST00000567147 KCNB2Q92953 911 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms