RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.2■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 SLC9A7Q96T83 725 aa23.2■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 ALG1Q9BT22 464 aa23.2■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 TET1Q8NFU7 2136 aa23.2■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF286BP0CG31 522 aa23.19■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 SELPP16109 830 aa23.19■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 SPATA33Q96N06 139 aa23.19■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 TRANK1O15050 2925 aa23.19■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 PRC1O43663 620 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 BAIAP3O94812 1187 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 CKBP12277 381 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 ICAM3P32942 547 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 PTK7Q13308 1070 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 NECTIN1Q15223 517 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 TMTC2Q8N394 836 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 TMEM87BQ96K49 555 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 MYL10Q9BUA6 226 aa23.18■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 MYO9BQ13459 2157 aa23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 SLC27A2O14975 620 aa23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 STAM2O75886 525 aa23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 CXCL10P02778 98 aa23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 KIF5BP33176 963 aa23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 MCM5P33992 734 aa23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 HIC1Q14526 733 aa23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 CASC1Q6TDU7 716 aa23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.17■■□□□ 1.3
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MFGE8-208ENST00000558773 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.17■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.16■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 SORBS3O60504 671 aa23.16■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 LIFRP42702 1097 aa23.16■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.16■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.16■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 REV3LO60673 3130 aa23.16■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 PIK3CDO00329 1044 aa23.15■■□□□ 1.3
MFGE8-208ENST00000558773 MEIS2O14770 477 aa23.15■■□□□ 1.3
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MFGE8-208ENST00000558773 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.14■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.14■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.14■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC69A6NI79 296 aa23.13■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 H3BRB1 525 aa23.13■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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MFGE8-208ENST00000558773 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.13■■□□□ 1.29
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MFGE8-208ENST00000558773 FIBPO43427 364 aa23.12■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 ARHGEF15O94989 841 aa23.12■■□□□ 1.29
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MFGE8-208ENST00000558773 CALM2P0DP24 149 aa23.12■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 CALM3P0DP25 149 aa23.12■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 TAP1Q03518 808 aa23.12■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 MBTPS1Q14703 1052 aa23.12■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 METTL7BQ6UX53 244 aa23.12■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.12■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 SERINC5Q86VE9 423 aa23.12■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.12■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 CUL5Q93034 780 aa23.12■■□□□ 1.29
MFGE8-208ENST00000558773 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
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