RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539305.1

AP002991.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AP002991.1, Length 574 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002991.1-201ENST00000539305 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 PSEN2P49810 448 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 TRDNQ13061 729 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 KRT40Q6A162 431 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 SESTD1Q86VW0 696 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.76□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 LCHNA4D1U4 455 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 PITPNM1O00562 1244 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 MEIS2O14770 477 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 SLC27A2O14975 620 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 PRC1O43663 620 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 GGPS1O95749 300 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 CA3P07451 260 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 POLR2MP0CAP2 368 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 LAMC2Q13753 1193 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 MFSD10Q14728 455 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 NECTIN1Q15223 517 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 RAB30Q15771 203 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 DGKDQ16760 1214 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 RETREG2Q8NC44 543 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 PPTC7Q8NI37 304 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 SPATA33Q96N06 139 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.75□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 PPFIA4O75335 1185 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 F2P00734 622 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 CKBP12277 381 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 SELPP16109 830 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 IGFBP4P22692 258 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 DEFB103AP81534 67 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 CREB3L3Q68CJ9 461 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 C7orf31Q8N865 590 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 NOD1Q9Y239 953 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 MYO7AQ13402 2215 aa9.74□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 ERICH2A1L162 156 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 ATP9AO75110 1047 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 CXCL10P02778 98 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 PFKMP08237 780 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 CCND2P30279 289 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 RFC2P35250 354 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 TAP1Q03518 808 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 RBL2Q08999 1139 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 BFSP2Q13515 415 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 RASEFQ8IZ41 740 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.73□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 H3BRB1 525 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 TREHO43280 583 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 LPXNO60711 386 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 LGALS2P05162 132 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 ICAM3P32942 547 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 MCM5P33992 734 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 PTK7Q13308 1070 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 UBE2SQ16763 222 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 TRIM50Q86XT4 487 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
AP002991.1-201ENST00000539305 MAP3K14Q99558 947 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms