RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526458.1

C9orf135-AS1-203, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MYSM1Q5VVJ2 828 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DEFB128Q7Z7B8 93 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 C7orf31Q8N865 590 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PIBF1Q8WXW3 757 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KAT2BQ92831 832 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CUL5Q93034 780 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SLC12A7Q9Y666 1083 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MICAL3Q7RTP6 2002 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CHD7Q9P2D1 2997 aa13.4□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PIK3CDO00329 1044 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PLEKHA8P1O95397 391 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF286BP0CG31 522 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PBX2P40425 430 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PSEN2P49810 448 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MFSD10Q14728 455 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GRIN2CQ14957 1233 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 AFAP1L1Q8TED9 768 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SPATA33Q96N06 139 aa13.39□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MYO9BQ13459 2157 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HAS3O00219 553 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PPFIA4O75335 1185 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CDC45O75419 566 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PARNO95453 639 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RXRAP19793 462 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RBL2Q08999 1139 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KIAA0753Q2KHM9 967 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HSDL1Q3SXM5 330 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SGMS1Q86VZ5 419 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 VWCEQ96DN2 955 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NEK1Q96PY6 1258 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ALG1Q9BT22 464 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LRRC2Q9BYS8 371 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MLXIPQ9HAP2 919 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HDAC6Q9UBN7 1215 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 VCANP13611 3396 aa13.38□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DLL1O00548 723 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MEIS2O14770 477 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FIBPO43427 364 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SORBS3O60504 671 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ICAM3P32942 547 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SP2Q02086 613 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NEDD9Q14511 834 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KRT32Q14532 448 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PCNX4Q63HM2 1172 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 XRRA1Q6P2D8 792 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TMTC3Q6ZXV5 915 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SKAP1Q86WV1 359 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MICU3Q86XE3 530 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FANCBQ8NB91 859 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SLC9A7Q96T83 725 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SLC28A3Q9HAS3 691 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 REV3LO60673 3130 aa13.37□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SIP14410 1827 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TRANK1O15050 2925 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NOP56O00567 594 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 BAIAP3O94812 1187 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SELPP16109 830 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PTK7Q13308 1070 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TSGA10IPQ3SY00 556 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 APOA5Q6Q788 366 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 USP17L6PQ6QN14 398 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LRRC8DQ7L1W4 858 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CTAGE1Q96RT6 745 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa13.35□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LGALS2P05162 132 aa13.35□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CKBP12277 381 aa13.35□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PPP2R2DQ66LE6 453 aa13.35□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 METTL7BQ6UX53 244 aa13.35□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NLRX1Q86UT6 975 aa13.35□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CCDC82Q8N4S0 544 aa13.35□□□□□ -0.27
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms