RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 LDHDQ86WU2 507 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 IFT74Q96LB3 600 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SLF1Q9BQI6 1058 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MYH8P13535 1937 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SMTNP53814 917 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 AP3B2Q13367 1082 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SYCP3Q8IZU3 236 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PAGE5Q96GU1 130 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 ABCB11O95342 1321 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 ATP8B1O43520 1251 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MORC3Q14149 939 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 LETM2Q2VYF4 491 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 ERO1BQ86YB8 467 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 GMCL1Q96IK5 515 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.47□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 SLC25A27O95847 323 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CA8P35219 290 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 UBASH3AP57075 661 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 FANCCQ00597 558 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 NPY5RQ15761 445 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CEP57Q86XR8 500 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 FAM76AQ8TAV0 307 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 DDX12PQ92771 950 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CCDC114Q96M63 670 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 IWS1Q96ST2 819 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 VPS18Q9P253 973 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CEP83Q9Y592 693 aa8.46□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 GDF11O95390 407 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 INPP5BP32019 993 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 EVX2Q03828 476 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 CALCRLQ16602 461 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 SPECC1Q5M775 1068 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 MXD3Q9BW11 206 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 EXOC1Q9NV70 894 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 IDEP14735 1019 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 AFMP43652 599 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 BICD1Q96G01 975 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 STK17AQ9UEE5 414 aa8.46□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 CYTH3O43739 400 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 FAM13AO94988 1023 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 SPDYE6P0CI01 402 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 UBXN2AP68543 259 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 NAA25Q14CX7 972 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 CABP7Q86V35 215 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 ASB14A6NK59 587 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 VGLL3A8MV65 326 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 TMOD1P28289 359 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 CCND2P30279 289 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 CACNB3P54284 484 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 ZSCAN26Q16670 478 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 AP1ARQ63HQ0 302 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 CHADLQ6NUI6 762 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 DISC1Q9NRI5 854 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 IFNKQ9P0W0 207 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 SLX4Q8IY92 1834 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 FAM205CA6NFA0 338 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 PTGS1P23219 599 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 USH1GQ495M9 461 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 SPATA1Q5VX52 437 aa8.45□□□□□ -1.06
USP54-210ENST00000466048 CCDC65Q8IXS2 484 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms