RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TMTC2Q8N394 836 aa24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM87BQ96K49 555 aa24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 GGPS1O95749 300 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF286BP0CG31 522 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 SELPP16109 830 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 MCM5P33992 734 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 PTK7Q13308 1070 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 GNPTABQ3T906 1256 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA33Q96N06 139 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL10P02778 98 aa24.25■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 ICAM3P32942 547 aa24.25■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 SP2Q02086 613 aa24.25■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.25■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.25■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 TRANK1O15050 2925 aa24.25■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 PIK3CDO00329 1044 aa24.24■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 PRC1O43663 620 aa24.24■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 CKBP12277 381 aa24.24■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 MYOGP15173 224 aa24.24■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 LIFRP42702 1097 aa24.24■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 GNAQP50148 359 aa24.24■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 GPNMBQ14956 572 aa24.24■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 TET1Q8NFU7 2136 aa24.24■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 PTPRSQ13332 1948 aa24.23■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 MUC3AQ02505 3323 aa24.23■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 NECTIN1Q15223 517 aa24.23■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.23■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.23■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 ALG1Q9BT22 464 aa24.23■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.23■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 SLC27A2O14975 620 aa24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 CA3P07451 260 aa24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 CALM1P0DP23 149 aa24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 CALM2P0DP24 149 aa24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 CALM3P0DP25 149 aa24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 MYL10Q9BUA6 226 aa24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC69A6NI79 296 aa24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 FIBPO43427 364 aa24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 HOXC8P31273 242 aa24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 NEDD9Q14511 834 aa24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 TJAP1Q5JTD0 557 aa24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 METTL7BQ6UX53 244 aa24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 CUL5Q93034 780 aa24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-208ENST00000428064 KIF28PB7ZC32 967 aa24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 MEIS2O14770 477 aa24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 NBNO60934 754 aa24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 KCNJ6P48051 423 aa24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 XIRP2A4UGR9 3374 aa24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 REV3LO60673 3130 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 H3BRB1 525 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 EFCAB14O75071 495 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 LGALS2P05162 132 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 IGFBP4P22692 258 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA3FQ13275 785 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 SERINC5Q86VE9 423 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 USP26Q9BXU7 913 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 THEGQ9P2T0 379 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 EMSYQ7Z589 1322 aa24.18■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.18■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 HIC1Q14526 733 aa24.18■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 WNT8BQ93098 351 aa24.18■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.18■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 SORBS3O60504 671 aa24.17■■□□□ 1.46
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