RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394011.7

RALGPS1-206, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 819 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-206ENST00000394011 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.64■■□□□ 1.22
RALGPS1-206ENST00000394011 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 DDAH1O94760 285 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 F2P00734 622 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 LAMC2Q13753 1193 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 PTGISQ16647 500 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 DGKDQ16760 1214 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 MYL10Q9BUA6 226 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 RBL2Q08999 1139 aa22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 HIC1Q14526 733 aa22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 MAP3K14Q99558 947 aa22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 REV3LO60673 3130 aa22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 POLR2MP0CAP2 368 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 ZNF286BP0CG31 522 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 CALM1P0DP23 149 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 CALM2P0DP24 149 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 CALM3P0DP25 149 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 CPA1P15085 419 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 KIF5BP33176 963 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 PSEN2P49810 448 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 CHMP4BP1P59074 171 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 FGD1P98174 961 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 BFSP2Q13515 415 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 ZBBXA8MT70 800 aa22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 PSMA5P28066 241 aa22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 RETREG2Q8NC44 543 aa22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 CAGE1Q8TC20 777 aa22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 WNT8BQ93098 351 aa22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 MUC3AQ02505 3323 aa22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 RXRAP19793 462 aa22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 MFSD10Q14728 455 aa22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 TCTN1Q2MV58 587 aa22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 NOD1Q9Y239 953 aa22.6■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 SORBS3O60504 671 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 ARHGEF15O94989 841 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 GGPS1O95749 300 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 TGFB3P10600 412 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 CCND2P30279 289 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 GNAQP50148 359 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 TRAF1Q13077 416 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 SEMA3FQ13275 785 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 ALG1Q9BT22 464 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 NBNO60934 754 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 PPFIA4O75335 1185 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 CXCL10P02778 98 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 CKBP12277 381 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 SMARCA1P28370 1054 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 ICAM3P32942 547 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 MICU3Q86XE3 530 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 SPATA33Q96N06 139 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 SLC9A7Q96T83 725 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-206ENST00000394011 MEIS2O14770 477 aa22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-206ENST00000394011 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-206ENST00000394011 ACTN1P12814 892 aa22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-206ENST00000394011 SELPP16109 830 aa22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-206ENST00000394011 RPS6KB1P23443 525 aa22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-206ENST00000394011 HOXC8P31273 242 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms