RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360286.2

SUDS3-201, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SUDS3, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-201ENST00000360286 JADE2Q9NQC1 790 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 DOCK5Q9H7D0 1870 aa7.32□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MYADML2A6NDP7 307 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 H3BQV1 296 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MEIS1O00470 390 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 WNT7AO00755 349 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 CTAGE5O15320 804 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MSCO60682 206 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 CAPN15O75808 1086 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 STAM2O75886 525 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 TDP2O95551 362 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 ATP2B1P20020 1258 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 SYT1P21579 422 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 ICAM3P32942 547 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 CIITAP33076 1130 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 USP11P51784 963 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 GJA9P57773 515 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 TTLL4Q14679 1199 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 LETM2Q2VYF4 491 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 DUSP28Q4G0W2 176 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 CEP55Q53EZ4 464 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 IFFO2Q5TF58 517 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MCTP1Q6DN14 999 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 SCFD2Q8WU76 684 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 GJA10Q969M2 543 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.31□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 FIBPO43427 364 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 ADAMTS4O75173 837 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 GGPS1O95749 300 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 GH1P01241 217 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 KCNA2P16389 499 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 CYP3A7P24462 503 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 ARHGAP1Q07960 439 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MTMR1Q13613 665 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 LRRC41Q15345 812 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 KCNA10Q16322 511 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 GNPTABQ3T906 1256 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 PRR16Q569H4 304 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 NEK8Q86SG6 692 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 TLK2Q86UE8 772 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 KLHDC9Q8NEP7 349 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 GPRASP2Q96D09 838 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 Q9Y3F1 56 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 KIF3AQ9Y496 699 aa7.3□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MSH4O15457 936 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MAFGO15525 162 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 SLC37A4O43826 429 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 MYL3P08590 195 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 TGFB3P10600 412 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 NKX3-2P78367 333 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 SP4Q02446 784 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 LAMC2Q13753 1193 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 BECN1Q14457 450 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 NEDD9Q14511 834 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 NBR1Q14596 966 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 ZNF174Q15697 407 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 Q4G0T1 1027 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 GNASQ5JWF2 1037 aa7.29□□□□□ -1.24
SUDS3-201ENST00000360286 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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