RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 USP11P51784 963 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 TLK2Q86UE8 772 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 COPS5Q92905 334 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 ICAM3P32942 547 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA3FQ13275 785 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 NEK8Q86SG6 692 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 CDHR1Q96JP9 859 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 AP5M1Q9H0R1 490 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 KIF28PB7ZC32 967 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 TGFB3P10600 412 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 LETM2Q2VYF4 491 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 SPC25Q9HBM1 224 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 MEIS1O00470 390 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 EDIL3O43854 480 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 SORBS3O60504 671 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 SYT1P21579 422 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 CIITAP33076 1130 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 SP2Q02086 613 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 PRR16Q569H4 304 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD4-201ENST00000306324 GH1P01241 217 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 ARP10275 920 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 NOSTRINQ8IVI9 506 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 Q9Y3F1 56 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 DNAH12Q6ZR08 3092 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 MAFGO15525 162 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTS4O75173 837 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 TDP2O95551 362 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 GGPS1O95749 300 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 GJA9P57773 515 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 RNF180Q86T96 592 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 ATP9AO75110 1047 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 NEDD9Q14511 834 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC41Q15345 812 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 UIMC1Q96RL1 719 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 MYADML2A6NDP7 307 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 ATP2B1P20020 1258 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 BEX3Q00994 111 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP1Q07960 439 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 GNASQ5JWF2 1037 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 KCNA2P16389 499 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 LENG9Q96B70 501 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
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HOXD4-201ENST00000306324 KBTBD13C9JR72 458 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 STX6O43752 255 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 CAPN2P17655 700 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 CYP3A7P24462 503 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 LAMC2Q13753 1193 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 DNM1LO00429 736 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 CTAGE5O15320 804 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 CPT1AP50416 773 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 SP4Q02446 784 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 Q4G0T1 1027 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 FERMT3Q86UX7 667 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 AFG1LQ8WV93 481 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA33Q96N06 139 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 SDF4Q9BRK5 362 aa25.34■■□□□ 1.65
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