RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246199.5

C20orf173-201, Transcript of chromosome 20 open reading frame 173, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene C20orf173, Length 1,034 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf173-201ENST00000246199 MEIS2O14770 477 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 CCND2P30279 289 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 SEMA3FQ13275 785 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 TCTN1Q2MV58 587 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 ADCK5Q3MIX3 580 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 USP38Q8NB14 1042 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 TMEM87BQ96K49 555 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 MAP3K14Q99558 947 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 NOD1Q9Y239 953 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 SCN5AQ14524 2016 aa11.3□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 PPFIA4O75335 1185 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 KIF5BP33176 963 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 LIFRP42702 1097 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 TRAF1Q13077 416 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 BFSP2Q13515 415 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 ADGRE1Q14246 886 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 SESTD1Q86VW0 696 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 TMTC2Q8N394 836 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 C7orf31Q8N865 590 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 FANCBQ8NB91 859 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 MTA3Q9BTC8 594 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 MLXIPQ9HAP2 919 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 MSRAQ9UJ68 235 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 SLC12A7Q9Y666 1083 aa11.29□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 PITPNM1O00562 1244 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 NBNO60934 754 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 ARHGEF15O94989 841 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 F2P00734 622 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 TGFB3P10600 412 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 CKBP12277 381 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 CPA1P15085 419 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 SMARCA1P28370 1054 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 GNAQP50148 359 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 RAB30Q15771 203 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 UBE2SQ16763 222 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 CYFIP1Q7L576 1253 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 PPM1EQ8WY54 764 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 NEK1Q96PY6 1258 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 LZTS2Q9BRK4 669 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 SLC28A3Q9HAS3 691 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 REV3LO60673 3130 aa11.28□□□□□ -0.6
C20orf173-201ENST00000246199 RFXAPO00287 272 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 ATP9AO75110 1047 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 PFKMP08237 780 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 SELPP16109 830 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 ICAM3P32942 547 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 MBTPS1Q14703 1052 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 ZNF618Q5T7W0 954 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 LRRC8DQ7L1W4 858 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 SGMS1Q86VZ5 419 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 MICU3Q86XE3 530 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 CUL5Q93034 780 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 GPR20Q99678 358 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 CERS4Q9HA82 394 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa11.27□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 TET1Q8NFU7 2136 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 H3BRB1 525 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 PIK3CDO00329 1044 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 CDC45O75419 566 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 LGALS2P05162 132 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 CALM1P0DP23 149 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 CALM2P0DP24 149 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 CALM3P0DP25 149 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 ITGB5P18084 799 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 IGFBP4P22692 258 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 RFC2P35250 354 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 SP4Q02446 784 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 PTK7Q13308 1070 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 APOA5Q6Q788 366 aa11.26□□□□□ -0.61
C20orf173-201ENST00000246199 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms