RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.95■■□□□ 1.1
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 DNERQ8NFT8 737 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTA3Q9BTC8 594 aa21.95■■□□□ 1.1
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 FBXO11Q86XK2 927 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RGS22Q8NE09 1264 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.86■■□□□ 1.09
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