RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fdxacb1Q3UY23 622 aa25.86■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Meis1Q60954 390 aa25.86■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbed4Q80WQ9 1168 aa25.86■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dusp4Q8BFV3 398 aa25.86■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MafaQ8CF90 359 aa25.86■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Coa7Q921H9 231 aa25.86■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Six6os1Q9CTN5 574 aa25.86■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tle2Q9WVB2 767 aa25.86■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa25.85■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mknk2Q8CDB0 459 aa25.85■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lmcd1Q8VEE1 365 aa25.85■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem39aQ9CYC3 486 aa25.85■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa25.85■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa25.85■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col5a3Q9JLI2 1739 aa25.85■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tex13cD3YU32 604 aa25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aldh1a1P24549 501 aa25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ptpn11P35235 597 aa25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc172Q810N9 267 aa25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P2ry10Q8BFU7 328 aa25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bcas3Q8CCN5 928 aa25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1494Q8VGP8 315 aa25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp2r2dQ925E7 453 aa25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Extl2Q9ES89 330 aa25.84■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm7356A0A087WSA6 508 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adam15O88839 864 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ArP19091 899 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FpgsP48760 587 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Srebf2Q3U1N2 1130 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grik5Q61626 979 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tcaf3Q6QR59 914 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Samm50Q8BGH2 469 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tas1r1Q99PG6 842 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Etnk1Q9D4V0 363 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dusp6Q9DBB1 381 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lypla2Q9WTL7 231 aa25.83■■□□□ 1.73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rgs9O54828 675 aa25.82■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Art2aP17981 287 aa25.82■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lman2lP59481 347 aa25.82■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LppQ8BFW7 613 aa25.82■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr81Q5ND34 1934 aa25.81■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Supt3B0QZW4 406 aa25.81■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acvr2bP27040 536 aa25.81■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf865Q3U3I9 1058 aa25.81■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddr2Q62371 854 aa25.81■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GypcQ78HU7 95 aa25.81■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Etv3Q8R4Z4 513 aa25.81■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf800Q0VEE6 662 aa25.8■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam89aQ14BJ1 175 aa25.8■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc9a1Q61165 820 aa25.8■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mtmr10Q7TPM9 771 aa25.8■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc9a7Q8BLV3 726 aa25.8■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CnstQ8CBC4 711 aa25.8■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Terf2ipQ91VL8 393 aa25.8■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa25.8■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PycardQ9EPB4 193 aa25.8■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif26aQ52KG5 1881 aa25.8■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pate3B3GLJ3 98 aa25.79■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnm1P39053 867 aa25.79■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ces1eQ64176 562 aa25.79■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arpp21Q9DCB4 807 aa25.79■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rad9aQ9Z0F6 389 aa25.79■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AdnpQ9Z103 1108 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TazI7HJS2 263 aa25.78■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FosbP13346 338 aa25.78■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NcanP55066 1268 aa25.78■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpatch11Q3UFS4 262 aa25.78■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa25.78■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Evc2Q8K1G2 1220 aa25.78■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim59Q922Y2 403 aa25.78■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smco2Q9DA21 347 aa25.78■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tfr2Q9JKX3 798 aa25.78■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm11549A0A286YD83 63 aa25.77■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm38392E9Q2A2 434 aa25.77■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DgkkE9Q7N4 1118 aa25.77■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eef2kO08796 724 aa25.77■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Madcam1Q61826 405 aa25.77■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa25.77■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3383J3QQ59 259 aa25.76■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppm1aP49443 382 aa25.76■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcif1P59114 706 aa25.76■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Syngap1F6SEU4 1340 aa25.76■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp27b1O35084 507 aa25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kpna6O35345 536 aa25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.1 ms