Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
Supt3B0QZW4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Supt3B0QZW4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Supt3B0QZW4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Supt3B0QZW4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Supt3B0QZW4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Supt3B0QZW4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Supt3B0QZW4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Supt3B0QZW4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Supt3B0QZW4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Supt3B0QZW4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Supt3B0QZW4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Supt3B0QZW4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Supt3B0QZW4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Supt3B0QZW4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Supt3B0QZW4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Supt3B0QZW4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Supt3B0QZW4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Supt3B0QZW4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Supt3B0QZW4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Supt3B0QZW4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Supt3B0QZW4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Supt3B0QZW4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Supt3B0QZW4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Supt3B0QZW4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Supt3B0QZW4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Supt3B0QZW4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Supt3B0QZW4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Supt3B0QZW4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Supt3B0QZW4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Supt3B0QZW4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Supt3B0QZW4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Supt3B0QZW4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Supt3B0QZW4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Supt3B0QZW4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Supt3B0QZW4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Supt3B0QZW4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Supt3B0QZW4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Supt3B0QZW4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Supt3B0QZW4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Supt3B0QZW4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Supt3B0QZW4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Supt3B0QZW4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Supt3B0QZW4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Supt3B0QZW4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Supt3B0QZW4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Supt3B0QZW4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Supt3B0QZW4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Supt3B0QZW4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Supt3B0QZW4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Supt3B0QZW4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Supt3B0QZW4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt3B0QZW4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Supt3B0QZW4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Supt3B0QZW4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Supt3B0QZW4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Supt3B0QZW4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Supt3B0QZW4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Supt3B0QZW4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Supt3B0QZW4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Supt3B0QZW4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Supt3B0QZW4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Supt3B0QZW4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Supt3B0QZW4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Supt3B0QZW4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Supt3B0QZW4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Supt3B0QZW4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Supt3B0QZW4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Supt3B0QZW4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Supt3B0QZW4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Supt3B0QZW4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Supt3B0QZW4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Supt3B0QZW4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Supt3B0QZW4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Supt3B0QZW4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Supt3B0QZW4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Supt3B0QZW4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Supt3B0QZW4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Supt3B0QZW4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Supt3B0QZW4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Supt3B0QZW4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Supt3B0QZW4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Supt3B0QZW4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Supt3B0QZW4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Supt3B0QZW4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Supt3B0QZW4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Supt3B0QZW4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Supt3B0QZW4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Supt3B0QZW4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Supt3B0QZW4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Supt3B0QZW4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Supt3B0QZW4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Supt3B0QZW4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Supt3B0QZW4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Supt3B0QZW4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Supt3B0QZW4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Supt3B0QZW4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Supt3B0QZW4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Supt3B0QZW4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Supt3B0QZW4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 557.5 ms