RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W DIT1P21623 536 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W ARO7P32178 256 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W GPT2P36148 743 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data10.01□□□□□ -0.81not detected
PRP4YPR178W MNN9P39107 395 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YER034WP40022 185 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W SPO73P40031 143 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W PRM8P53174 237 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W NUT2Q06213 157 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W SVS1Q12254 260 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W DST1P07273 309 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W CIT2P08679 460 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W SSA1P10591 642 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W TRM1P15565 570 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W RCK1P38622 512 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W URA8P38627 578 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W CCT6P39079 546 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W ALG8P40351 577 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YKE4P40544 346 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W MEP2P41948 499 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YNL181WP53878 407 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YMD8Q03697 442 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YOL036WQ08206 761 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YOL131WQ08270 108 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YLR126CQ12288 251 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W GTT2Q12390 233 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W NSI1Q12457 570 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W SNF8Q12483 233 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YLR149CQ99296 730 aa10□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W GRX2P17695 143 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W SDH3P33421 198 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W NIC96P34077 839 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W ADD66P36040 267 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W BAP2P38084 609 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W RPH1P39956 796 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W VAC8P39968 578 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W MPM1P40364 252 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W SKP2P42843 763 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W RMD8P43620 662 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W MRH4P53166 561 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W COS7Q07788 383 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W UPC2Q12151 913 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W RAD59Q12223 238 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YOR131CQ12486 218 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa9.99□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W ECM29P38737 1868 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W PHO4P07270 312 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W ALG7P07286 448 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data9.98□□□□□ -0.81not detected
PRP4YPR178W SDH2P21801 266 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W IDP1P21954 428 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W PHO84P25297 587 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W DCC1P25559 380 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W THI4P32318 326 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W ZRT3P34240 503 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W NAT2P37293 288 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W DUN1P39009 513 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W AFG3P39925 761 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W MEP1P40260 492 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W NTA1P40354 457 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YGR210CP42942 411 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W RET2P43621 546 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W MNN5P46982 586 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W DML1Q03652 475 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W PEX27Q08580 376 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W FMP16Q12497 93 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W Q0010Q9ZZX9 128 aa9.98□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W PDE2P06776 526 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W MAS1P10507 462 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W DBP3P20447 523 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W ATG22P25568 528 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W DSS4P32601 143 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W POL12P38121 705 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W LDB7P38210 180 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W MBA1P38300 278 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W PRE6P40303 254 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W BIT61P47041 543 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W TIS11P47977 285 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YAT1P80235 687 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YPL071CQ02864 156 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W BSC2Q05611 235 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YDR056CQ12025 205 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W YDR061WQ12298 539 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W ATG31Q12421 196 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W LAG2Q92325 660 aa9.97□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W HTA1P04911 132 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W SPS1P08458 490 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W MET8P15807 274 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W PRI2P20457 528 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W THI80P35202 319 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W YCR087C-AP37263 153 aa9.96□□□□□ -0.82
PRP4YPR178W GND1P38720 489 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.9 ms