RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A RBD2Q12270 262 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A BUD4P47136 1447 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A TRP1P00912 224 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ERG8P24521 451 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A DIA4P38705 446 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A IGD1P43598 195 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MRPS16Q02608 121 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A NUP100Q02629 959 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SLX4Q12098 748 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A IZH2Q12442 317 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A RPA190P10964 1664 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A AIM10P39965 576 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A ECM27P47144 725 aa0.28□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YLR152CP54072 576 aa0.28□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YPR195CQ06594 109 aa0.28□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A CTI6Q08923 506 aa0.28□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A BI3Q9ZZW7 517 aa0.28□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MMS22Q06164 1454 aa0.28□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A HIR3P47171 1648 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PMR1P13586 950 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A CLB2P24869 491 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A STE50P25344 346 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A BRF1P29056 596 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A GLC7P32598 312 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A COS9P36034 407 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PFS1P38872 237 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YIL059CP40520 121 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MET5P47169 1442 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A INO80P53115 1489 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PEX22P39718 180 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A INN1P53901 409 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PNG1Q02890 363 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A RSN1Q03516 953 aa0.27□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A STE2D6VTK4 431 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A SOD1P00445 154 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A CHO1P08456 276 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A HSC82P15108 705 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A AST1P35183 429 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MMS4P38257 691 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A AIP1P46680 615 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A NCS2P53923 493 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A RNH201P53942 307 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A DIA1P54005 336 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A CTF3Q12748 733 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PHM8P40025 321 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A NRM1P53718 249 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A CDC16P09798 840 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A GFD2P25370 566 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YBR241CP38142 488 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MAD2P40958 196 aa0.26□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PUT2P07275 575 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MAS2P11914 482 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A RPL3P14126 387 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A OCA5P38738 679 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A CDC1P40986 491 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A RAD30Q04049 632 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A RLP24Q07915 199 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A TLG2Q08144 397 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YDL012CQ12489 107 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PDR10P51533 1564 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A FOB1O13329 566 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PSY4P38193 441 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PSD1P39006 500 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A UIP3P39547 235 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A BNI5P53890 448 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A TIM18Q08749 192 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A NAG1Q8TGN9 163 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YML003WP0CF16 290 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A ART10P18634 518 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A URA4P20051 364 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A LYS14P40971 790 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A BUD6P41697 788 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A SGM1P47166 707 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A IMA1P53051 589 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YNR061CP53747 219 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A MET14Q02196 202 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PRM6Q04705 352 aa0.25□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A COR1P07256 457 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A ITR2P30606 609 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YER186CP40101 306 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YJR085CP47131 105 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A TOF2Q02208 771 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data0.24□□□□□ -2.37not detected
YPL060C-AYPL060C-A AHC1Q12433 566 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A HIS4P00815 799 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A GAL80P04387 435 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A SLM5P25345 492 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A ATS1P31386 333 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A ZUO1P32527 433 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A YBR144CP34215 104 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A TSC10P38342 320 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data0.24□□□□□ -2.37not detected
YPL060C-AYPL060C-A MIG3P39943 394 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PAN6P40459 309 aa0.24□□□□□ -2.37
YPL060C-AYPL060C-A PIB2P53191 635 aa0.24□□□□□ -2.37
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