RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	RED1	P14291	827 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	AFG1	P32317	509 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	REC114	P32841	428 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	FRE2	P36033	711 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	SDS24	P38314	527 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	YGR149W	P48236	432 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	BOR1	P53838	576 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	TAF11	Q04226	346 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	TLG2	Q08144	397 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	YLL056C	Q12177	298 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	RTN2	Q12443	393 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	BNI1	P41832	1953 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	MDS3	P53094	1487 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	SPS4	P09937	338 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	CBS2	P14905	389 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	PCA1	P38360	1216 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	GCD10	P41814	478 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	VTC2	P43585	828 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	SRB7	P47822	140 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	CAF40	P53829	373 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	WSC2	P53832	503 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	PIR3	Q03180	325 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	VTA1	Q06263	330 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	HNT3	Q08702	217 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	PMR1	P13586	950 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	ATP10	P18496	279 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	CLB3	P24870	427 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	NDI1	P32340	513 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	ERG3	P32353	365 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	AVT5	P38176	459 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	ARK1	P53974	638 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	SCM3	Q12334	223 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	RRD2	Q12461	358 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YLR224W	YLR224W	YLR278C	Q05854	1341 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	HIP1	P06775	603 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	NIP100	P33420	868 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	JNM1	P36224	373 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	YBR139W	P38109	508 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	THI2	P38141	450 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	RRT5	P43607	289 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	AVT4	P50944	713 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	POP6	P53218	158 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	PNG1	Q02890	363 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	ODC1	Q03028	310 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	YLR287C	Q05881	355 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	RSA1	Q08932	381 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	SFI1	Q12369	946 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	LTE1	P07866	1435 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	CLC1	P17891	233 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	PPH22	P23595	377 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	YCR100C	P25606	316 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	NPL6	P32832	435 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	NFU1	P32860	256 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	YPI1	P43587	155 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	DSL1	P53847	754 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	IBD2	P53892	351 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	MRP51	Q02950	344 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	HEM15	P16622	393 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	YIM1	P28625	365 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	MRP4	P32902	394 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	SAS3	P34218	831 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	HCS1	P34243	683 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	YCR041W	P37265	110 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	TRS85	P46944	698 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	SSN8	P47821	323 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	FMS1	P50264	508 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	YGL242C	P53066	181 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	HSP31	Q04432	237 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YLR224W	YLR224W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.8 ms