RNA–Protein interactions for RNA: YLR107W

REX3, Transcript of RNA exonuclease, yeast

Gene REX3, Length 1,215 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REX3	YLR107W	PMR1	P13586	950 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	RED1	P14291	827 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	ATP10	P18496	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	AFG1	P32317	509 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	YBP1	P38315	674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	INH1	P01097	85 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	CBS2	P14905	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	GYP6	P32806	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	RSM22	P36056	628 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	THI2	P38141	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	AVT5	P38176	459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	RRT5	P43607	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	PIR3	Q03180	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	HNT3	Q08702	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	SPS4	P09937	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	NDI1	P32340	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	NPL6	P32832	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	SRB7	P47822	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	AVT4	P50944	713 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
REX3	YLR107W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.61	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	HIP1	P06775	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	VTC2	P43585	828 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	TRS85	P46944	698 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	CAF40	P53829	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	VTA1	Q06263	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	YIM1	P28625	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	NIP100	P33420	868 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	SCM3	Q12334	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
REX3	YLR107W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	PPH22	P23595	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YCR100C	P25606	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	REC114	P32841	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YPI1	P43587	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	PNG1	Q02890	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	ODC1	Q03028	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	RSA1	Q08932	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.58	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	NFU1	P32860	256 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	SAS3	P34218	831 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	POP6	P53218	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	CHS1	P08004	1131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	RIP1	P08067	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	CLB3	P24870	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	MRP4	P32902	394 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	SFI1	Q12369	946 aa		4.56	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	HEM15	P16622	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	CLC1	P17891	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YOX1	P34161	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	JNM1	P36224	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YCR041W	P37265	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	SPG5	P42933	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	HSP31	Q04432	237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	SEC63	P14906	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	SNT1	P25357	1226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	ECM25	P32525	599 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	RML2	P32611	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	HCS1	P34243	683 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YBR139W	P38109	508 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YIP1	P53039	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	PCP1	P53259	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	DSL1	P53847	754 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	MRP51	Q02950	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	SIL1	Q08199	421 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	NAT2	P37293	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	VHC1	P38329	1120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	FMS1	P50264	508 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	IBD2	P53892	351 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REX3	YLR107W	YIL067C	P40514	678 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REX3	YLR107W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REX3	YLR107W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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