RNA–Protein interactions for RNA: YLL017W

YLL017W, Transcript of Non-essential Ras guanine nucleotide exchange factor (GEF), yeast

Gene YLL017W, Length 312 nt, Biotype pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL017W	YLL017W	NIP100	P33420	868 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	CBP4	P37267	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	THI2	P38141	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	MET30	P39014	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	FAU1	P40099	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YLL017W	YLL017W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SYO1	Q07395	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	HSP42	Q12329	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	ERV1	P27882	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	VHC1	P38329	1120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SEC5	P89102	971 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	HOT1	Q03213	719 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
YLL017W	YLL017W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	VAM3	Q12241	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	PPZ1	P26570	692 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	FRE1	P32791	686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	TRS65	P32893	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SLM4	P38247	162 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	RRT2	P38332	387 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	YND1	P40009	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	CDC23	P16522	626 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	BUB3	P26449	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	KRE2	P27809	442 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	BZZ1	P38822	633 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	VPS52	P39904	641 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	MPS1	P54199	764 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	RCF1	Q03713	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	VPS74	Q06385	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	NRT1	Q08485	598 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	MED2	Q12124	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	ICT1	Q12385	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL017W	YLL017W	HIP1	P06775	603 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	GEX1	P25596	615 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	SIN4	P32259	974 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	HIR2	P32480	875 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	TMT1	P32643	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	IRC15	Q02733	499 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	ACL4	Q03771	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	NUP53	Q03790	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	HSP31	Q04432	237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	RKM5	Q12367	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	BNI1	P41832	1953 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	SEC63	P14906	663 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	URA4	P20051	364 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	RIM2	P38127	377 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	RFC3	P38629	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	PES4	P39684	611 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	IKS1	P47042	667 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	TOM22	P49334	152 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	MMR1	Q06324	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	CLN1	P20437	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	BRF1	P29056	596 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	LTV1	P34078	463 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	MMS4	P38257	691 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	JEM1	P40358	645 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	MDM30	Q05930	598 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	BEM1	P29366	551 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	ELP2	P42935	788 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	SAD1	P43589	448 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	YGR111W	P53265	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	DSL1	P53847	754 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	GPM3	Q12326	303 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	CTF3	Q12748	733 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	SPO7	P18410	259 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	APE4	P38821	490 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	SAS2	P40963	338 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	ECM27	P47144	725 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	DCS1	Q06151	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YLL017W	YLL017W	GRS2	Q06817	618 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.5 ms