RNA–Protein interactions for RNA: YJL126W

NIT2, Transcript of Nit protein, yeast

Gene NIT2, Length 924 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NIT2	YJL126W	MHT1	Q12525	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	HIS5	P07172	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	FUS1	P11710	512 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	KAR1	P11927	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	URA4	P20051	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	CLN2	P20438	545 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	SOL2	P37262	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	GIC1	P38785	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YHR078W	P38799	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	GDH3	P39708	457 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	AYR1	P40471	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YFR018C	P43599	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YJR149W	P47177	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	MPS2	P53159	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	CAF120	P53836	1060 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	MPS1	P54199	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	SDH1	Q00711	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	PLP1	Q04004	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	ARG7	Q04728	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	GRS2	Q06817	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	MSH5	Q12175	901 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	TAF3	Q12297	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	PSY3	Q12318	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
NIT2	YJL126W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	MPD2	Q99316	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	STT4	P37297	1900 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	ATP4	P05626	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	TOP3	P13099	656 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	UGA1	P17649	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	PET112	P33893	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	COS111	P38308	924 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	FTH1	P38310	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	DSS1	P39112	969 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	FAA2	P39518	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YEL073C	P39974	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	CAB2	P40506	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	AZF1	P41696	914 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	GCV1	P48015	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	MRK1	P50873	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	MTO1	P53070	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	ZRG17	P53735	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	TGL2	P54857	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	SMA1	Q02651	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	MMT1	Q03218	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	VHS1	Q03785	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	ECM11	Q04110	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	PSR1	Q07800	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	RPN6	Q12377	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	SNF8	Q12483	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	MRP13	P12686	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	STE6	P12866	1290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	SNF4	P12904	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	PRI2	P20457	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YSR3	P23501	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	HXT4	P32467	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	PEP12	P32854	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YKR015C	P36111	568 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	SKG1	P36169	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	HXT5	P38695	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	ATG7	P38862	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	YHR218W	P38899	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	HXT7	P39004	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	MTW1	P39731	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	GAB1	P41733	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIT2	YJL126W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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