RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	ARG81	P05085	880 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.68	□□□□□ -1.98	not detected
ECM29	YHL030W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	EMC1	P25574	760 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SRB6	P32570	121 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YBL010C	P32788	280 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	NIC96	P34077	839 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MSC7	P38694	644 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	CCT6	P39079	546 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	NPR2	P39923	615 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YAT2	P40017	923 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	FKH2	P41813	862 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PUS2	P53167	370 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	DAM1	P53267	343 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YPR003C	P53394	754 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	NSG2	P53898	299 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	HXT15	P54854	567 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MEH1	Q02205	184 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SPP2	Q02521	185 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	NUP116	Q02630	1113 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SWC7	Q06707	132 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PCL9	Q12477	304 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	USO1	P25386	1790 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	CDC23	P16522	626 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	DAL81	P21657	970 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PEX1	P24004	1043 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	GIT1	P25346	518 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	IST2	P38250	946 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	RCK1	P38622	512 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	ARP1	P38696	384 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	CHL4	P38907	458 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	VPS70	P47161	811 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	COS10	P52924	374 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	KXD1	P53158	218 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SHY1	P53266	389 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YAT1	P80235	687 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	COQ9	Q05779	260 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YDL121C	Q07541	149 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	DIN7	Q12086	430 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	DIT1	P21623	536 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SEC17	P32602	292 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SRP101	P32916	621 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	CAF4	P36130	643 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YBR032W	P38223	100 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MAD2	P40958	196 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	NET1	P47035	1189 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	VOA1	P53262	265 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YDR124W	Q04608	324 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	BOP2	Q06150	570 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	GTT2	Q12390	233 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YPR1	Q12458	312 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YLR278C	Q05854	1341 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PUP1	P25043	261 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YSC84	P32793	468 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SEC61	P32915	480 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.68	□□□□□ -1.98	not detected
ECM29	YHL030W	ARN2	P38724	620 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	UBP5	P39944	805 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	QDR1	P40475	563 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	BRE2	P43132	505 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MNN5	P46982	586 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MDE1	P47095	244 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	CTR1	P49573	406 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YMR130W	Q04223	302 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YBR085C-A	O43137	85 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SAM35	P14693	329 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	AHC2	P25649	128 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	BIO2	P32451	375 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	UTR2	P32623	467 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PTM1	P32857	523 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SET3	P36124	751 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YBR139W	P38109	508 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SEA4	P38164	1038 aa		2.67	□□□□□ -1.98

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