RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W ATG7P38862 630 aa8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W DIM1P41819 318 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W IRC15Q02733 499 aa8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MET31Q03081 177 aa8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MMT1Q03218 510 aa8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MUM3Q08750 479 aa8.57□□□□□ -1.04
DDI1YER143W ARG3P05150 338 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MSS116P15424 664 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W TRX3P25372 127 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W ATP7P30902 174 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W ATO2P32907 282 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W KKQ8P36004 724 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W CAB2P40506 365 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W SSU1P41930 458 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MNN10P50108 393 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W GET1P53192 235 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W COS6P53344 381 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YNL033WP53964 284 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YNL019CP53975 284 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W RPM2Q02773 1202 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W SPC2Q04969 178 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MLH3Q12083 715 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W HAL9Q12180 1030 aa8.56□□□□□ -1.04
DDI1YER143W RAS2P01120 322 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
DDI1YER143W KAR1P11927 433 aa8.55□□□□□ -1.04
DDI1YER143W TOP3P13099 656 aa8.55□□□□□ -1.04
DDI1YER143W GAR1P28007 205 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
DDI1YER143W FAD1P38913 306 aa8.55□□□□□ -1.04
DDI1YER143W AZF1P41696 914 aa8.55□□□□□ -1.04
DDI1YER143W GAB1P41733 394 aa8.55□□□□□ -1.04
DDI1YER143W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
DDI1YER143W HOT1Q03213 719 aa8.55□□□□□ -1.04
DDI1YER143W HFD1Q04458 532 aa8.55□□□□□ -1.04
DDI1YER143W NMD4Q12129 218 aa8.55□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YAK1P14680 807 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W PRI2P20457 528 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W PPH21P23594 369 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W AST1P35183 429 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W CBP4P37267 147 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W TRM7P38238 310 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W DSS1P39112 969 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W ECM10P39987 644 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W VRG4P40107 337 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W SEC26P41810 973 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W ZIM17P42844 174 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W FMP32P43557 207 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MUP1P50276 574 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YNL140CP53910 189 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W SWS2P53937 143 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W RAD33Q04231 177 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YOL131WQ08270 108 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YLL054CQ12244 843 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W GPR1Q12361 961 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W ADF1Q2V2Q1 113 aa8.54□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YPR096CO13587 100 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W COX3P00420 269 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MSS18P08593 268 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YAP1P19880 650 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W ERG6P25087 383 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W TFB1P32776 642 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W SPO23P33757 523 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W PEX6P33760 1030 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MRP8P35719 219 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W COS111P38308 924 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W TDP1P38319 544 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W PLB1P39105 664 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W RGI1P40043 161 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W FMP33P46998 180 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YJR142WP47173 342 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W ERG26P53199 349 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W TRM82Q03774 444 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YDR444WQ04093 687 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W YML053CQ04978 212 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W VPS74Q06385 345 aa8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data8.53□□□□□ -1.04not detected
DDI1YER143W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
DDI1YER143W MDM35O60200 86 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY2A-FP0CX61 438 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY2A-GR2P0CX62 438 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W RVS161P25343 265 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W TY2A-CP25383 438 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W MEI5P32489 222 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W NGG1P32494 702 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W PET309P32522 965 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W SEC17P32602 292 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W MRT4P33201 236 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W SKG1P36169 355 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W PIM1P36775 1133 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YHR218WP38899 603 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W ERV46P39727 415 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W YAL037WP39728 267 aa8.52□□□□□ -1.05
DDI1YER143W APQ12P40532 138 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.6 ms