RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W PSK1P31374 1356 aa3.37□□□□□ -1.87
VFA1YER128W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GCN4P03069 281 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SCEIP03882 235 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W LEU4P06208 619 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RAD7P06779 565 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CAR2P07991 424 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MET2P08465 486 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TCP1P12612 559 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CDC23P16522 626 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CMK2P22517 447 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GIT1P25346 518 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PMT2P31382 759 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W DBF4P32325 704 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TPO5P36029 618 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YKL133CP36066 463 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NAT2P37293 288 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W APL3P38065 1025 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HMT1P38074 348 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ECM31P38122 312 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MAL33P38157 468 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CDS1P38221 457 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MMS4P38257 691 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SSH1P38353 490 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YHR182WP38870 785 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W AVT6P40074 448 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SCC4P40090 624 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GID8P40208 455 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SOK1P40317 901 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ICE2P40499 491 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W AXL1P40851 1208 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ERG10P41338 398 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W VMA13P41807 478 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PMT6P42934 759 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SWP82P43554 623 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPC17P47076 161 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YJR056CP47115 236 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PSP1P50896 841 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RTA1P53047 317 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MET13P53128 600 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SNF12P53628 566 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RAD30Q04049 632 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W URC2Q04411 772 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RCO1Q04779 684 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GTB1Q04924 702 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W FMP42Q04991 504 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W BOP2Q06150 570 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W BCP1Q06338 283 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W THI22Q06490 572 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ATG23Q06671 453 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SNA4Q07549 140 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data3.36□□□□□ -1.87not detected
VFA1YER128W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GET4Q12125 312 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TY3A-GQ12173 290 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MDY2Q12285 212 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MTR10Q99189 972 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TY3A-IQ99219 290 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W POM152P39685 1337 aa3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
VFA1YER128W STU1P38198 1513 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GDB1Q06625 1536 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ATG2P53855 1592 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TPK2P06245 380 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PRB1P09232 635 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RAD18P10862 487 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PCK1P10963 549 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GLN4P13188 809 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SNA3P14359 133 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W FBA1P14540 359 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CBP3P21560 335 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W UBC1P21734 215 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SNT1P25357 1226 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ERG1P32476 496 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GSH1P32477 678 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PAH1P32567 862 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MDL1P33310 695 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ADE17P38009 592 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PRS2P38620 318 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RFC3P38629 340 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YDR089WP38966 869 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W STT3P39007 718 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W VMA7P39111 118 aa3.35□□□□□ -1.87
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