RNA–Protein interactions for RNA: YAL067C

SEO1, Transcript of Putative permease, yeast

Gene SEO1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEO1	YAL067C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SEG1	Q04279	960 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ARO10	Q06408	635 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RAD34	Q06665	692 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	NTO1	Q12311	748 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ATP10	P18496	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ERG4	P25340	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RHB1	P25378	209 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	CAB3	P36076	571 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MRPL37	P36532	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	BRO1	P48582	844 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SPO19	Q03029	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	LDB17	Q12342	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RAV1	P47104	1357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SCEI	P03882	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SPS22	P25380	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PEX32	P38292	413 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	TAX4	P47030	604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RAD17	P48581	401 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YGL185C	P53100	379 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YGR126W	P53274	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	STD1	Q02794	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
SEO1	YAL067C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ALG7	P07286	448 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	UGA1	P17649	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MRPL25	P23369	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	STE11	P23561	717 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PSO2	P30620	661 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	COT1	P32798	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SHP1	P34223	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	GMH1	P36125	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	DUG2	P38149	878 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MIT1	P40002	666 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SCC4	P40090	624 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	CDC1	P40986	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YFL015C	P43578	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	GTO1	P48239	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YTP1	P53584	459 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ERV41	Q04651	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RAP1	P11938	827 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YCL068C	P25593	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MRPL9	P31334	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	EFM2	P38347	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PEX18	P38855	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	TDA10	P42938	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MND1	P53102	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RTT102	P53330	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	CSI1	Q04368	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	THP1	Q08231	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	GEP3	Q08622	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	CLB2	P24869	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RNQ1	P25367	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YSC83	P32792	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PPS1	P38148	807 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SWC5	P38326	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ERG7	P38604	731 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YGL117W	P53133	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RIM8	P53179	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YNL050C	P53952	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	BOP2	Q06150	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	VAC14	Q06708	880 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RBD2	Q12270	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RPC34	P32910	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MIA40	P36046	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YMC2	P38087	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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