RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.01■■□□□ 1.11
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CTDP1-208ENST00000613122 MEIS1O00470 390 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 ATP5OP48047 213 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 PTPROQ16827 1216 aa22.01■■□□□ 1.11
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CTDP1-208ENST00000613122 OGFRQ9NZT2 677 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.01■■□□□ 1.11
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CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PQ64 194 aa22■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PQD8 194 aa22■■□□□ 1.11
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CTDP1-208ENST00000613122 ANAPC5Q9UJX4 755 aa21.98■■□□□ 1.11
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CTDP1-208ENST00000613122 MED7O43513 233 aa21.97■■□□□ 1.11
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CTDP1-208ENST00000613122 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 CLIC2O15247 247 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 ANXA13P27216 316 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 MARK3P27448 753 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 GUCY2FP51841 1108 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 SNAP25P60880 206 aa21.96■■□□□ 1.11
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