RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589266.5

CIRBP-223, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 3

Gene CIRBP, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-223	ENST00000589266	BTBD18	B2RXH4	712 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	STRN	O43815	780 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	TNFRSF25	Q93038	417 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	MSC	O60682	206 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	CFB	P00751	764 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	PKP1	Q13835	747 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	MCTP1	Q6DN14	999 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	OXER1	Q8TDS5	423 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	F13A1	P00488	732 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	FCER1A	P12319	257 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	REST	Q13127	1097 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	KCTD2	Q14681	263 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	NSMF	Q6X4W1	530 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	TBC1D5	Q92609	795 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	CNGA1	P29973	690 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	NR5A1	Q13285	461 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	UBE2S	Q16763	222 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	WDR78	Q5VTH9	848 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	MMP19	Q99542	508 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	KIF28P	B7ZC32	967 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	DNM1L	O00429	736 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	PTPRE	P23469	700 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	TTC28	Q96AY4	2481 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CIRBP-223	ENST00000589266	ADAMTS3	O15072	1205 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	RTP1	P59025	263 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	28.57	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	HOXC6	P09630	235 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	TRAPPC10	P48553	1259 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	FERMT3	Q86UX7	667 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	ANO3	Q9BYT9	981 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	TMEM260	Q9NX78	707 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	EYS	Q5T1H1	3165 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	GRB14	Q14449	540 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	DNER	Q8NFT8	737 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		28.55	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	SHH	Q15465	462 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	COL20A1	Q9P218	1284 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	CYP2C19	P33261	490 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	SREBF1	P36956	1147 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	ATL3	Q6DD88	541 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	USP11	P51784	963 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	RMDN3	Q96TC7	470 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266	LTBP2	Q14767	1821 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CIRBP-223	ENST00000589266		B4DLN1	442 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CIRBP-223	ENST00000589266	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
CIRBP-223	ENST00000589266	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
CIRBP-223	ENST00000589266	TBCK	Q8TEA7	893 aa		28.51	■■■□□ 2.15

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