RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 CALCRLQ16602 461 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 POLD4Q9HCU8 107 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 ARHGAP4P98171 946 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 PKP1Q13835 747 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 TTLL4Q14679 1199 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 TTC38Q5R3I4 469 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 NEK8Q86SG6 692 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 SPATA33Q96N06 139 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 BARHL2Q9NY43 387 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 PNMA2Q9UL42 364 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 STRNO43815 780 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 GGPS1O95749 300 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 ADCYAP1R1P41586 468 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 BEX3Q00994 111 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 JMYQ8N9B5 988 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 TNFAIP2Q03169 654 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 MAP2K5Q13163 448 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 ARMCX2Q7L311 632 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 NEMFO60524 1076 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 LY6KQ17RY6 165 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 TDP2O95551 362 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 RNF169Q8NCN4 708 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 COPS5Q92905 334 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CFAP45Q9UL16 551 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 PTGS1P23219 599 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 STAMQ92783 540 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 TINF2Q9BSI4 451 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 KBTBD13C9JR72 458 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 MEIS1O00470 390 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 KRT79Q5XKE5 535 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 KIF2CQ99661 725 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 SRRDQ9UH36 339 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CLGNO14967 610 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 INHAP05111 366 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 PTPREP23469 700 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CA8P35219 290 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 COPB2P35606 906 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 ISM2Q6H9L7 571 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 PFASO15067 1338 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 TM4SF4P48230 202 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 TRIM32Q13049 653 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 ERMNQ8TAM6 284 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 AFMP43652 599 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 PTGDRQ13258 359 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 MTFR1Q15390 333 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 CALML4Q96GE6 196 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 TCHPQ9BT92 498 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 WBP1LQ9NX94 342 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 STXBP3O00186 592 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-202ENST00000538886 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms