RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533744.6

SLC38A6-215, Transcript of solute carrier family 38 member 6, human

TSL 5

Gene SLC38A6, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A6-215	ENST00000533744	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	NCAPH	Q15003	741 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	KY	Q8NBH2	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	MYO1B	O43795	1136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	VAMP1	P23763	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	THBS2	P35442	1172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	BCL6	P41182	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	GJA8	P48165	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	DIO2	Q92813	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	NKX3-2	P78367	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	LGI4	Q8N135	537 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	TBX1	O43435	398 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	DDAH1	O94760	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	ITGA1	P56199	1179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	ADAM17	P78536	824 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLC38A6-215	ENST00000533744	PLAT	P00750	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	ITGAV	P06756	1048 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	HOXC12	P31275	282 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744		B2RBV5	119 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	SLC6A11	P48066	632 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	GTF2A2	P52657	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	CPZ	Q66K79	652 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	CP	P00450	1065 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	LCP1	P13796	627 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	IL13	P35225	146 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	LSAMP	Q13449	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A6-215	ENST00000533744	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms