RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496043.5

PTPRF-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRF, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-214ENST00000496043 RNF20Q5VTR2 975 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 GUCD1Q96NT3 240 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 LAMA3Q16787 3333 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 CALM1P0DP23 149 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 CALM2P0DP24 149 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 CALM3P0DP25 149 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 TGFB3P10600 412 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 CYP2C9P11712 490 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 LIFRP42702 1097 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 CHMP4BP1P59074 171 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 ARHGAP1Q07960 439 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 PGM5Q15124 567 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 DGKDQ16760 1214 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 RASIP1Q5U651 963 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 RETREG2Q8NC44 543 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 HERVK_113Q902F9 699 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 MMP3P08254 477 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 CCND2P30279 289 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 MYL10Q9BUA6 226 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 NOD1Q9Y239 953 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 PPFIA4O75335 1185 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 RGS20O76081 388 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 BFSP2Q13515 415 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 SKAP1Q86WV1 359 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 PPTC7Q8NI37 304 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 CUL5Q93034 780 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 SCLYQ96I15 445 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 STAM2O75886 525 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 PFKMP08237 780 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 DNAJB2P25686 324 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 PTGISQ16647 500 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 SESTD1Q86VW0 696 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 FANCBQ8NB91 859 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 KAT2BQ92831 832 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 TIFAQ96CG3 184 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 NEK1Q96PY6 1258 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 MSRAQ9UJ68 235 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-214ENST00000496043 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PITPNM1O00562 1244 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 CDC45O75419 566 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 GGPS1O95749 300 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 IQCF3P0C7M6 154 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 RFC2P35250 354 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PSEN2P49810 448 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 GNPTABQ3T906 1256 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 C7orf31Q8N865 590 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 IL31RAQ8NI17 732 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 SPATA33Q96N06 139 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 ALG1Q9BT22 464 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PBX4Q9BYU1 374 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF576Q9H609 170 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 MYH6P13533 1939 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 PIK3CDO00329 1044 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 ACTN1P12814 892 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 RXRAP19793 462 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 SP2Q02086 613 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 RAB30Q15771 203 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRF-214ENST00000496043 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms