RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473062.1

CLCC1-208, Transcript of chloride channel CLIC like 1, human

TSL 3

Gene CLCC1, Length 319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLCC1-208	ENST00000473062	SOD2	P04179	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	GNAT1	P11488	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	IGFALS	P35858	605 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	MVK	Q03426	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	ARVCF	O00192	962 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	PAX4	O43316	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	PAPLN	O95428	1278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	CPE	P16870	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	BCL6	P41182	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	ERVFC1	P60507	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	NTRK3	Q16288	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	INF2	Q27J81	1249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	SP110	Q9HB58	689 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	OPA1	O60313	960 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	PEX10	O60683	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	SEMA7A	O75326	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	CRTAM	O95727	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	DBH	P09172	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	GLI4	P10075	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	TACR1	P25103	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	SOX5	P35711	763 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	CRY1	Q16526	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	BLACE	A4D250	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	PFKL	P17858	780 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	GJA4	P35212	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	RNF38	Q9H0F5	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	NTRK1	P04629	796 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	LCP1	P13796	627 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	FPR2	P25090	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLCC1-208	ENST00000473062	OCRL	Q01968	901 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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