RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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TTC28-204ENST00000468807 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TTC28-204ENST00000468807 NOD1Q9Y239 953 aa25.24■■□□□ 1.63
TTC28-204ENST00000468807 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TTC28-204ENST00000468807 POLR2MP0CAP2 368 aa25.23■■□□□ 1.63
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TTC28-204ENST00000468807 LY9Q9HBG7 655 aa25.23■■□□□ 1.63
TTC28-204ENST00000468807 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TTC28-204ENST00000468807 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
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TTC28-204ENST00000468807 GHRHRQ02643 423 aa25.22■■□□□ 1.63
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TTC28-204ENST00000468807 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.2■■□□□ 1.62
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TTC28-204ENST00000468807 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.18■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.18■■□□□ 1.62
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TTC28-204ENST00000468807 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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TTC28-204ENST00000468807 MTA3Q9BTC8 594 aa25.17■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.17■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa25.17■■□□□ 1.62
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TTC28-204ENST00000468807 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.16■■□□□ 1.62
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TTC28-204ENST00000468807 CHD9Q3L8U1 2897 aa25.16■■□□□ 1.62
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TTC28-204ENST00000468807 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 MYO9BQ13459 2157 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 TANC1Q9C0D5 1861 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 PITPNM1O00562 1244 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 IQCF3P0C7M6 154 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 CALM1P0DP23 149 aa25.14■■□□□ 1.62
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