RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 RAB30Q15771 203 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 MYLIPQ8WY64 445 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 SENP2Q9HC62 589 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 MSRAQ9UJ68 235 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 RFC2P35250 354 aa23.38■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 SCLYQ96I15 445 aa23.38■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 CYTH3O43739 400 aa23.37■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 PGM5Q15124 567 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 PPTC7Q8NI37 304 aa23.36■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 LY9Q9HBG7 655 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.36■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 TGFB3P10600 412 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 SMARCA1P28370 1054 aa23.35■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 RNF20Q5VTR2 975 aa23.35■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.34■■□□□ 1.33
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TTC9B-201ENST00000311308 CUL5Q93034 780 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 STAM2O75886 525 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 PBX2P40425 430 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC9B-201ENST00000311308 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 PPFIA4O75335 1185 aa23.32■■□□□ 1.32
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TTC9B-201ENST00000311308 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
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TTC9B-201ENST00000311308 KAT2BQ92831 832 aa23.32■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 SPATA33Q96N06 139 aa23.32■■□□□ 1.32
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TTC9B-201ENST00000311308 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.32■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 CDH23Q9H251 3354 aa23.32■■□□□ 1.32
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TTC9B-201ENST00000311308 NECTIN1Q15223 517 aa23.31■■□□□ 1.32
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TTC9B-201ENST00000311308 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.31■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 RGS20O76081 388 aa23.3■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 MFSD10Q14728 455 aa23.3■■□□□ 1.32
TTC9B-201ENST00000311308 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.3■■□□□ 1.32
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