RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)L

tS(GCU)L, Transcript of Asparagine tRNA (tRNA-Asn), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tS(GCU)L, Length 80 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)LtS(GCU)L HXT4P32467 576 aa8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L SUI1P32911 108 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L HXT6P39003 570 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L HXT7P39004 570 aa8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L RPS26AP39938 119 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L RPS26BP39939 119 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L VMA13P41807 478 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L PMT4P46971 762 aa8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L YNL260CP53846 198 aa8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L BOP3P53958 396 aa8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L NHP10Q03435 203 aa8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L YPR011CQ12251 326 aa8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L SRN2Q99176 213 aa8.4□□□□□ -1.06
tS(GCU)LtS(GCU)L COX6P00427 148 aa8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L ROX1P25042 368 aa8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L NUD1P32336 851 aa8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L GCD11P32481 527 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data8.39□□□□□ -1.07not detected
tS(GCU)LtS(GCU)L ALG3P38179 458 aa8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L ROG1P53118 685 aa8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L RPN14P53196 417 aa8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L BUD32P53323 261 aa8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L SLT2Q00772 484 aa8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L YDR541CQ03049 344 aa8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L VAM6Q07468 1049 aa8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L YOR032W-AQ8TGS1 66 aa8.39□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L GUK1P15454 187 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L RPB4P20433 221 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L KRE6P32486 720 aa8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L OMA1P36163 345 aa8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L YBR062CP38239 180 aa8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L YBR071WP38243 211 aa8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L OM14P38325 134 aa8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L NEO1P40527 1151 aa8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L MAD2P40958 196 aa8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L AZF1P41696 914 aa8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L NMD5P46970 1048 aa8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L SHY1P53266 389 aa8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L ADE13Q05911 482 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L BOP2Q06150 570 aa8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L PAR32Q12515 295 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L COR1P07256 457 aa8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L MSS116P15424 664 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L PTM1P32857 523 aa8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L SDH3P33421 198 aa8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L MUD2P36084 527 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L APT2P36973 181 aa8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L MET12P46151 657 aa8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L BPL1P48445 690 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L COG6P53959 839 aa8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L YSA1Q01976 231 aa8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L RRP40Q08285 240 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L ACM1Q08981 209 aa8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L MDM32Q12171 622 aa8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L UBX3Q12229 455 aa8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L COX17Q12287 69 aa8.37□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L IME2P32581 645 aa8.36□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L CAJ1P39101 391 aa8.36□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L RPL10P41805 221 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L HST2P53686 357 aa8.36□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L ATG4P53867 494 aa8.36□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L OAZ1Q02803 292 aa8.36□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L CYK3Q07533 885 aa8.36□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L RUD3Q12234 484 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L CMD1P06787 147 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L CBF1P17106 351 aa8.35□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L SPO16P17122 198 aa8.35□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L AMD2P22580 549 aa8.35□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L LHS1P36016 881 aa8.35□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L EBP2P36049 427 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L SPC42P36094 363 aa8.35□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L TAT2P38967 592 aa8.35□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L PAC11P40960 533 aa8.35□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L YLR177WQ06251 628 aa8.35□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L STP22P25604 385 aa8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L PAP1P29468 568 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L MLS1P30952 554 aa8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L HES1P35843 434 aa8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L SEC27P41811 889 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L SEH1P53011 349 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L GIP3Q03016 1276 aa8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L VPS16Q03308 798 aa8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L TAF12Q03761 539 aa8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L URH1Q04179 340 aa8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L YMR027WQ04371 470 aa8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L CRN1Q06440 651 aa8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L NOB1Q08444 459 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
tS(GCU)LtS(GCU)L SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
tS(GCU)LtS(GCU)L GCG1P32656 232 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
tS(GCU)LtS(GCU)L REI1P38344 393 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
tS(GCU)LtS(GCU)L TPA1P40032 644 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
tS(GCU)LtS(GCU)L CAB2P40506 365 aa8.33□□□□□ -1.08
tS(GCU)LtS(GCU)L SPT20P50875 604 aa8.33□□□□□ -1.08
tS(GCU)LtS(GCU)L SDT1P53078 280 aa8.33□□□□□ -1.08
tS(GCU)LtS(GCU)L SML1Q04964 104 aa8.33□□□□□ -1.08
tS(GCU)LtS(GCU)L RAD34Q06665 692 aa8.33□□□□□ -1.08
tS(GCU)LtS(GCU)L REX4Q08237 289 aa8.33□□□□□ -1.08
tS(GCU)LtS(GCU)L MDY2Q12285 212 aa8.33□□□□□ -1.08
tS(GCU)LtS(GCU)L KAR4P25583 335 aa8.32□□□□□ -1.08
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