RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A CDC26P14724 124 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A EPT1P22140 391 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PTP2P29461 750 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SRB5P32585 307 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SIP2P34164 415 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ALY1P36117 915 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SOL2P37262 315 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CST26P38226 397 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A OST1P41543 476 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A LCL3P53153 274 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CWC25P53854 179 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A HRT3Q12347 344 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MES1P00958 751 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A RPS19AP07280 144 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A LPD1P09624 499 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A AAT2P23542 418 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MCM3P24279 971 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A HEM12P32347 362 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CYS4P32582 507 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YPT35P38815 214 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A KAP123P40069 1113 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ESL1P40456 1118 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ERP1Q05359 219 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MLC2Q06580 163 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MHR1Q06630 226 aa0.31□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SPS22P25380 463 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MTC7P32633 139 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PPQ1P32945 549 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MTR2P34232 184 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SPT10P35208 640 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SWD3P38123 315 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A GPP2P40106 250 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A RPR2P40571 144 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A HMS2P47175 358 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A DSD1P53095 428 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A BOR1P53838 576 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ASI1P54074 624 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PPM1Q04081 328 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SSP2Q08646 371 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PDE2P06776 526 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PRR1P28708 518 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A EFM2P38347 419 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A OSH3P38713 996 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A AXL2P38928 823 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A GWT1P47026 490 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MSY1P48527 492 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A FOL1P53848 824 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A IBD2P53892 351 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ELP3Q02908 557 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YDR115WQ04598 105 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PHO92Q06390 306 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YBR126W-AQ8TGU7 68 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SEC53P07283 254 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A REC107P21651 314 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A POL4P25615 582 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CDC60P26637 1090 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YKL100CP34248 587 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YBR071WP38243 211 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A NIT2P47016 307 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A AVT4P50944 713 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A BUD32P53323 261 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A OGG1P53397 376 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A AIM6Q07716 390 aa0.3□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PRB1P09232 635 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CDC24P11433 854 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PHO84P25297 587 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A AFG1P32317 509 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A MIA40P36046 403 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A VPS41P38959 992 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A STT3P39007 718 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A COX14P39103 70 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CSM2P40465 213 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PRM5P40476 318 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ASG7P46993 209 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CBK1P53894 756 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YIH1P25637 258 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YPT7P32939 208 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ECM34P38728 170 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A FMP10P40098 244 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YDR131CQ03899 556 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YOL057WQ08225 711 aa0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A CUE5Q08412 411 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A FLO11P08640 1367 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A SAL1D6W196 494 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A ARG4P04076 463 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data0.28□□□□□ -2.36not detected
YPL060C-AYPL060C-A RPB2P08518 1224 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data0.28□□□□□ -2.36not detected
YPL060C-AYPL060C-A HEM15P16622 393 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A YCR022CP25620 114 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A HXT1P32465 570 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PAH1P32567 862 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A AAP1P37898 856 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A RTC2P38279 296 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PHO90P39535 881 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A VPS8P39702 1274 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A VTC2P43585 828 aa0.28□□□□□ -2.36
YPL060C-AYPL060C-A PAP2P53632 584 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
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