RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	DBP8	P38719	431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YHR078W	P38799	552 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	FMO1	P38866	432 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	GLG2	P47011	380 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	AIF1	P52923	378 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	COG7	P53195	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	CLD1	P53264	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SHY1	P53266	389 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	VAC7	P53950	1165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SLM2	P53955	656 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	GTR1	Q00582	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SPC24	Q04477	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	BCH1	Q05029	724 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	ICT1	Q12385	394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	ADE8	P04161	214 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	MSF1	P08425	469 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	EXO70	P19658	623 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	FZO1	P38297	855 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	RFC3	P38629	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	MUP3	P38734	546 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YHR045W	P38775	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	VEL1	P53058	206 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	EMC4	P53073	190 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	ZRG17	P53735	605 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	RMI1	Q02685	241 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	TAF12	Q03761	539 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	CDA1	Q06702	301 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	PER33	Q12144	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	UBX3	Q12229	455 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	GAL11	P19659	1081 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	EPT1	P22140	391 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SPR1	P32603	445 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	PMT1	P33775	817 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YKL069W	P36088	180 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	ALY1	P36117	915 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	PCL5	P38794	229 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	CCT6	P39079	546 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	PLB1	P39105	664 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YER158C	P40095	573 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	MGS1	P40151	587 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SER33	P40510	469 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	PRM2	P40534	656 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	CHA4	P43634	648 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	BIR1	P47134	954 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	COQ5	P49017	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	GTR2	P53290	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YNL260C	P53846	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YML131W	Q03102	365 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	GOT1	Q03554	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	FMN1	Q03778	218 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	GRS2	Q06817	618 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	IRC10	Q08118	586 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SEC63	P14906	663 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	NPP1	P25353	742 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	PTM1	P32857	523 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YKL097C	P34245	136 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	MUM2	P38236	366 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	TAE1	P38340	232 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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