RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeastyeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIN4YMR138W GAL4P04386 881 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TY2A-FP0CX61 438 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TY2A-GR2P0CX62 438 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W RAP1P11938 827 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W MRP13P12686 339 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W RED1P14291 827 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W CMP2P14747 604 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W PHO81P17442 1178 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W SGV1P23293 657 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W PTP1P25044 335 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W SPS22P25380 463 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TY2A-CP25383 438 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W RAD14P28519 371 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W SSH4P32343 579 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W MEI5P32489 222 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W DOM34P33309 386 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W SHU2P38957 223 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W FRT2P39734 528 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W VRG4P40107 337 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W APQ12P40532 138 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W CCT7P42943 550 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W AIM22P47051 409 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W NRM1P53718 249 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W UBP2Q01476 1272 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W RPM2Q02773 1202 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TY2A-DR2Q03483 438 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W ROY1Q04847 553 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W XYL2Q07993 356 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W IRC13Q08630 104 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TY2A-BQ12260 438 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TY2A-OR2Q12293 438 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W YDR262WQ12331 272 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W JLP1Q12358 412 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TY2A-DR1Q12392 438 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TY2A-OR1Q12439 438 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W LAG2Q92325 660 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W SRN2Q99176 213 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TY2A-DR3Q99303 438 aa5.7□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W YPR096CO13587 100 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W ATP6P00854 259 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W RNA1P11745 407 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TYR1P20049 452 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TRX3P25372 127 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data5.69□□□□□ -1.5not detected
CIN4YMR138W CWP1P28319 239 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W NTH1P32356 751 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W RRN10P38204 145 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W UME6P39001 836 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W AYR1P40471 297 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W RLP7P40693 322 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W RNR4P49723 345 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W MIG2P53035 382 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W KXD1P53158 218 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W ERG26P53199 349 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W ARE2P53629 642 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W IDP3P53982 420 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W SPC24Q04477 213 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W YLR456WQ06199 204 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W GGA1Q06336 557 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W YLR030WQ07967 263 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W YOR114WQ12219 294 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W YLL054CQ12244 843 aa5.69□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TEL1P38110 2787 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W MST1P07236 462 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W PDC5P16467 563 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W PRP4P20053 465 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W MLS1P30952 554 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W CDC5P32562 705 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W SFA1P32771 386 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W TOA1P32773 286 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W PET112P33893 541 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W PTC1P35182 281 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W CUE2P36075 443 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W YBL029WP38201 376 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W MET30P39014 640 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W PRM10P42946 383 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W GTO1P48239 356 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W RIM21P48565 533 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W DIA3P52290 468 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W USE1P53146 245 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W YGR012WP53206 393 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W FHN1P53279 174 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W ESF2P53743 316 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W REX2P54964 269 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W MMT1Q03218 510 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W DIC1Q06143 298 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W PUS9Q12069 462 aa5.68□□□□□ -1.5
CIN4YMR138W BMT6Q12291 365 aa5.68□□□□□ -1.5
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