RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A ZPR1P53303 486 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A YSA1Q01976 231 aa2.29□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A CDC24P11433 854 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A ART10P18634 518 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A YIH1P25637 258 aa2.28□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A WWM1P43582 211 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A ARC1P46672 376 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A SHY1P53266 389 aa2.28□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A IPI3P53877 555 aa2.28□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A TOF2Q02208 771 aa2.28□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
YMR001C-AYMR001C-A PET123P17558 318 aa2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A PRE8P23639 250 aa2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A BUB3P26449 341 aa2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A SDH3P33421 198 aa2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A AIM22P47051 409 aa2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A HAL1Q01766 294 aa2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A TSA2Q04120 196 aa2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A HRI1Q05905 244 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A YLR108CQ12259 485 aa2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A SKM1Q12469 655 aa2.27□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A EST1P17214 699 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A YCK1P23291 538 aa2.26□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A RSM22P36056 628 aa2.26□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A POP6P53218 158 aa2.26□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A BSC5P53755 489 aa2.26□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A RNY1Q02933 434 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A YMR027WQ04371 470 aa2.26□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A RRN3P36070 627 aa2.25□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A PAN6P40459 309 aa2.25□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A TMA108P40462 946 aa2.25□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A OST1P41543 476 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A ALK1P43633 760 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A HEF3P53978 1044 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A WTM1Q12363 437 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A PAH1P32567 862 aa2.24□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A MRS6P32864 603 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A KEL1P38853 1164 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A IES5P40060 125 aa2.24□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A SIM1P40472 476 aa2.24□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A NCA3P46955 337 aa2.24□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A SAM1P10659 382 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A SAM2P19358 384 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A DAL2P25335 343 aa2.23□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A ATP11P32453 318 aa2.23□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A MRP21P38175 177 aa2.23□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A CCT6P39079 546 aa2.23□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A ISC1P40015 477 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A PRM5P40476 318 aa2.23□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A LYS14P40971 790 aa2.23□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A IBD2P53892 351 aa2.23□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A YPL199CQ08954 240 aa2.23□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A COR1P07256 457 aa2.22□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A YCR100CP25606 316 aa2.22□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A MFT1P33441 392 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A MIX23P38162 196 aa2.22□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A MSR1P38714 643 aa2.22□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A ALG5P40350 334 aa2.22□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A IMD4P50094 524 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YMR001C-AYMR001C-A PRP2P20095 876 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A SEF1P34228 1148 aa2.21□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A STB6P36085 766 aa2.21□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A YBL029WP38201 376 aa2.21□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A MSG5P38590 489 aa2.21□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A MBB1P39534 108 aa2.21□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A SYG1P40528 902 aa2.21□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A NGL3Q03210 505 aa2.21□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A CHS3P29465 1165 aa2.2□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A CRM1P30822 1084 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A YHR131CP38835 850 aa2.2□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A POP1P41812 875 aa2.2□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A OGG1P53397 376 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A PAP1P29468 568 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A MRPL10P36520 322 aa2.19□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.19□□□□□ -2.06not detected
YMR001C-AYMR001C-A TRS85P46944 698 aa2.19□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A PEX25Q02969 394 aa2.19□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A ODC1Q03028 310 aa2.19□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A MFB1Q04922 465 aa2.19□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A RLM1Q12224 676 aa2.19□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A YBR126W-AQ8TGU7 68 aa2.19□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A YPT6Q99260 215 aa2.19□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A MNS1P32906 549 aa2.18□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A HCS1P34243 683 aa2.18□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A RIB5P38145 238 aa2.18□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A HXT11P54862 567 aa2.18□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A YML131WQ03102 365 aa2.18□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A RSN1Q03516 953 aa2.18□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A ATG16Q03818 150 aa2.18□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A CCH1P50077 2039 aa2.17□□□□□ -2.06
YMR001C-AYMR001C-A YAR066WP0CX18 203 aa2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.1 ms