RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	TWF1	P53250	332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YGR117C	P53270	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ARL3	Q02804	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	GPN3	Q06543	272 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	FEX2	Q08991	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SRF1	Q12516	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MET17	P06106	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SNF6	P18888	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	LAC1	P28496	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ACH1	P32316	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	NDI1	P32340	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	KAP122	P32767	1081 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SRB2	P34162	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PTC1	P35182	281 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	KKQ8	P36004	724 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SKG1	P36169	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	WSS1	P38838	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CHS6	P40955	746 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	LCB2	P40970	561 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SIP4	P46954	829 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SHY1	P53266	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YNR062C	P53748	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
SFI1	YLL003W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ATP25	Q03153	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SKY1	Q03656	742 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	VID22	Q05934	901 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	THI22	Q06490	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RFU1	Q08003	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	FRE3	Q08905	711 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RUP1	Q12242	671 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MIH1	P23748	554 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RHB1	P25378	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	GPI10	P30777	616 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	DAL3	P32459	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SHP1	P34223	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	LEU5	P38702	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CFD1	P40558	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	HXT8	P40886	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	AGP3	P43548	558 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	OTU1	P43558	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YJL016W	P47072	561 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	AMA1	P50082	593 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SWC4	P53201	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MTQ1	P53944	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	TRM82	Q03774	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RSF1	Q05043	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CDA2	Q06703	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RSB1	Q08417	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CYT1	P07143	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	TGL1	P34163	548 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ALY1	P36117	915 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	MRPL3	P36516	390 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ETR1	P38071	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	ARA1	P38115	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	FMP23	P38231	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CYC2	P38909	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YER085C	P40058	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	DIA1	P54005	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YEH1	Q07804	573 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YRR1	Q12172	810 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	DGK1	Q12382	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	CCP1	P00431	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	URA3	P03962	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PEP5	P12868	1029 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	GAL3	P13045	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	STE50	P25344	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PRR1	P28708	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	OAR1	P35731	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	AME1	P38313	324 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	COS8	P38723	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	IMA5	P40884	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	FMP33	P46998	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	RSM27	P53305	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	COQ6	P53318	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SFI1	YLL003W	YAP6	Q03935	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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