RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A PET130P47065 347 aa2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A ZPR1P53303 486 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A RSA1Q08932 381 aa2.33□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A FOB1O13329 566 aa2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YCR022CP25620 114 aa2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YBR225WP38321 900 aa2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MBB1P39534 108 aa2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YPI1P43587 155 aa2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A GWT1P47026 490 aa2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A URB2P47108 1174 aa2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MSO1P53604 210 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A RRI2Q12348 645 aa2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A SEC39Q12745 709 aa2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A CTF3Q12748 733 aa2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.32□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MES1P00958 751 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A PMR1P13586 950 aa2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MET8P15807 274 aa2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A RNA14P25298 677 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A CRM1P30822 1084 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YOX1P34161 385 aa2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A CBP4P37267 147 aa2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A CST26P38226 397 aa2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A SDS24P38314 527 aa2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A PCA1P38360 1216 aa2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A UTP9P38882 575 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YGL242CP53066 181 aa2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A OGG1P53397 376 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A ARE2P53629 642 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A SLG1P54867 378 aa2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A RPT6Q01939 405 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A HNT3Q08702 217 aa2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YCL021W-AQ96VH3 125 aa2.31□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A TOP1P04786 769 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A ATP11P32453 318 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A RSM22P36056 628 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A FAU1P40099 211 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A SPO22P40511 975 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A DOT5P40553 215 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A POP1P41812 875 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A OCA1P50946 238 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A TWF1P53250 332 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A WSC2P53832 503 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YDR239CQ03780 787 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A PDS5Q04264 1277 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MFB1Q04922 465 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A ATG29Q12092 213 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MED1Q12321 566 aa2.3□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YML133CQ03099 1374 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YLL067CQ07888 1374 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YLL066CQ99208 1374 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A LEU4P06208 619 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MRP7P12687 371 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A CPR1P14832 162 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A BUB3P26449 341 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A SEC66P33754 206 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A CMC1P36064 111 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YEL057CP39983 233 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MET18P40469 1032 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MKT1P40850 830 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data2.29□□□□□ -2.04not detected
RPC10YHR143W-A CAF40P53829 373 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A TIM10P87108 93 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A SMA2Q04658 369 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A SOV1Q04748 898 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A MRD1Q06106 887 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A RKM5Q12367 367 aa2.29□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A ARG3P05150 338 aa2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A HIP1P06775 603 aa2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A RHO2P06781 192 aa2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A GYP6P32806 458 aa2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A REC114P32841 428 aa2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A FRE2P36033 711 aa2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A VID24P38263 362 aa2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A SYG1P40528 902 aa2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A SPG5P42933 373 aa2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YGL108CP53139 140 aa2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A PIR3Q03180 325 aa2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A HEL2Q05580 639 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RPC10YHR143W-A YAR066WP0CX18 203 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A YHR214WP0CX19 203 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A REV1P12689 985 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SPT15P13393 240 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A FUN19P28003 413 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A RAD14P28519 371 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A NDI1P32340 513 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A MRP4P32902 394 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SWH1P35845 1188 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A KEL1P38853 1164 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A GCD10P41814 478 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A HXT14P42833 540 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A POP6P53218 158 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A JJJ1P53863 590 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A IBD2P53892 351 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A ARK1P53974 638 aa2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A SUB1P54000 292 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RPC10YHR143W-A RRN11Q04712 507 aa2.27□□□□□ -2.05
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