RNA–Protein interactions for RNA: YHR065C

RRP3, Transcript of Protein involved in rRNA processing, yeast

Gene RRP3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP3	YHR065C	STE5	P32917	917 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	PMT1	P33775	817 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	NUP120	P35729	1037 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ECM1	P39715	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YEN1	P40028	759 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	NNF1	P47149	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GNP1	P48813	663 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SWC4	P53201	476 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	FRE4	P53746	719 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	VAC7	P53950	1165 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	HXT15	P54854	567 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	TGL2	P54857	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GLO2	Q05584	274 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	NSE1	Q07913	336 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ESA1	Q08649	445 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SPT3	P06844	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SPS22	P25380	463 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	PHO91	P27514	894 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SFP1	P32432	683 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YKL097C	P34245	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	FRE2	P36033	711 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	IML3	P38265	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MED8	P38304	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	TRM5	P38793	499 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	PCL5	P38794	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	TIM17	P39515	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	JEM1	P40358	645 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GAT1	P43574	510 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YFR018C	P43599	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YJR154W	P47181	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	NAS6	P50086	228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	IMA1	P53051	589 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	COG2	P53271	262 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	TRM12	Q04235	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	BCH1	Q05029	724 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	BCP1	Q06338	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CDA1	Q06702	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YEH2	Q07950	538 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	UAF30	Q08747	228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MCH5	Q08777	521 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GPB1	Q08886	897 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	DAP1	Q12091	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	UPC2	Q12151	913 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SAS5	Q99314	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MET8	P15807	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	PPZ1	P26570	692 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CSE1	P33307	960 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	FTH1	P38310	465 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	UBA4	P38820	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	EMP65	P40085	556 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MET18	P40469	1032 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	FKH2	P41813	862 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GCD10	P41814	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YGL108C	P53139	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	COG7	P53195	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	NMA2	P53204	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YET2	Q04210	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	FAR10	Q06001	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RIF2	Q06208	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GGA1	Q06336	557 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	MRL1	Q06815	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GRS2	Q06817	618 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	PSR1	Q07800	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	NSL1	Q12143	216 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	YLR358C	O13565	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	PHO5	P00635	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	COS2	P0CX12	379 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	COS3	P0CX13	379 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	REC107	P21651	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	CSM1	P25651	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RRP3	YHR065C	SIN4	P32259	974 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.1 ms